飛行船上，小智和超夢都被眼前這個自稱迷之收藏家吉爾露太的神秘男人給“抓”了。小智與超夢以及火焰鳥被關在了一個很大的空間中。
吉爾露太看到超夢開心道：“沒想到你居然有人造寶可夢超夢啊！還真是意外之喜，雖然讓閃電鳥跑了，但我隻需要再去抓一次就行了！”
小智問道：“既然都被你抓了，我想知道你抓三聖鳥的目的是不是海之神洛奇亞呢？”
吉爾露太大笑道：“沒錯！收藏家要做的就是將自己的藏品展示出來，三聖鳥和洛奇亞就是目對我而言最好的收藏品，對了小弟弟還要加上你的超夢。”吉爾露太按下了一個按鈕，小智從特製的籠子裏放了出來。
吉爾露太道：“你是多餘的，就讓你在這裏盡情欣賞我的收藏品吧！不過可不能用手碰哦！這可是基本的禮節。”
吉爾露太笑著滿意的離開了！
小智站了起來，露出了一個狡黠的笑容，太自信就是吉爾露太的致命弱點，他拿出了夢幻的大師球：“夢幻就決定是你了！”
“咪嗚！”小智我在精靈球裏都聽到了。
小智之前的z手環在大木博士那裏，他之後又花了的積分兌換了三個，準備給夥伴們用，沒想到現在有了用武之地。他從係統背包中拿出了其中一個z手環，更換上了夢幻z。
“上吧！夢幻！瞄準那個黑色圓環，使用起源超新星大爆炸！”
“咪嗚！”夢幻的專屬z招式命中了黑色圓環。
超夢在黑色圓環碎裂的時候，使用了精神擊破直接脫困。小智假裝被抓住，就是要趁機將火焰鳥救出來。
小智焦急道：“火焰鳥你沒事吧！”
“我沒事，隻是被吸走了太多的力量了，現在沒有力氣。”火焰鳥用心電感應對小智說道。
【火焰鳥】
【屬性：火、飛行】
【特性：壓迫感（給予對手壓迫感，大量減少其使用的招式的pp）】
【實力：神獸級（神職）】
小智跟124號兌換了一個可以恢複火係寶可夢體力的能量方塊。火焰鳥吃下後，精神了不少，124號出品必是精品，效果很是明顯。
“咪嗚。”小智你看外麵。
小智抬頭看去，透過飛行器的玻璃，外麵竟然開始下暴風雪了！
“夢幻用你的瞬間移動我們去冰之島！”
“咪嗚！”好的！
夢幻的瞬間移動包裹住小智、皮卡丘、超夢以及火焰鳥，眼前的景物一閃就到了冰之島上空。
小智的身體在猛地下墜，火焰鳥將其托在了背上。
小智對夢幻和超夢道：“你們都先回來吧！”隨即小智對火焰鳥道：“火焰鳥帶我先去找我的同伴吧！”
“坐穩了！”火焰鳥加快了速度。
這時，小智的通信裝置響了起來，渡道：“小智，你那邊情況怎麽樣了？”
小智道：“渡先生，我將火焰鳥救出來了！”
渡道：“具體的我們等事情結束再說，我遇到你的同伴們了，我去拿冰之島的寶藏，雷之島的寶藏就交給你了！”
小智道：“好，渡先生我們在亞西亞島見。”
小智掛斷了通信裝置，對火焰鳥道：“火焰鳥我們轉道去雷之島。”
冰之島附近被困在結凍海麵上的小霞等人，聽到渡得到了小智的消息後都鬆了口氣。渡對眾人道：“我現在去拿冰之島的寶藏，火焰鳥已經被小智救了出來。”
小智這邊也在雷之島上拿到了寶藏，火焰鳥突然向身後使用了噴射火焰，失去理智的急凍鳥使用了急凍光線對抗火焰鳥的噴射火焰。
【急凍鳥】
【屬性：冰、飛行】
【特性：壓迫感（給予對手壓迫感，大量減少其使用的招式的pp）】
【實力：神獸級（神職）】
火焰鳥道：“小智你快走！我和閃電鳥的力量都被吸走了大半，我擋不住急凍鳥的，你先回亞西亞島！”
小智擔心道：“火焰鳥，你撐的住嗎？”
火焰鳥道：“時間不長，應該問題不大。小智你是那位大人選中的訓練家，這件事隻有你能去辦，你先回亞西亞島。海底的另外一個大人也快醒了！我隻需要拖住一時半刻就行了！”
小智道：“好，我能感覺到閃電鳥也在趕過來的路上了。”小智抱上皮卡丘，坐在了大嘴雀的背上，就先離開了。
火焰鳥說的對，要想讓急凍鳥平靜下來，必須將寶藏放到它們應該在的地方。在三分鍾後，閃電鳥也趕到了，三聖鳥在空中纏鬥在了一起，但閃電鳥和火焰鳥的力量明顯被急凍鳥給壓製著。
突然一道衝天的海流攔在了三聖鳥的中間，是洛奇亞。洛奇亞終於也醒了！
【洛奇亞】
【屬性：超能、飛行】
【特性：壓迫感（給予對手壓迫感，大量減少其使用的招式的pp）】
【實力：神獸級（神職）】
悠揚的笛聲在這個時候響起，這是芙盧拉？
小智看見了小剛駕駛著船朝小智的方向駛來，小智跳到了甲板上，小霞關心道：“小智你沒事吧！”
小智搖了搖頭：“我沒事！果然跟傳說一樣，芙盧拉的笛子有安撫眾神的作用。”
芙盧拉的笛子讓戰鬥的場麵平緩了不少。
渡的聲音傳來：“小智，接住！我還要去逮捕那個謎之收藏家。”小智伸手將東西接住，這下三個寶藏集齊了。渡調轉了方向，去追逃跑的吉爾露太。
小剛也加大了馬力，朝亞西亞島趕了回去。
二十分鍾後，小智一行人趕往神殿。小智將三顆珠子放在了對應的位置後，朝芙盧拉點了點頭，芙盧拉悠揚的笛聲再次響起，這次天空中的雷雲開始消散，暴風雪也停止了，急凍鳥也慢慢地平靜了下來。
小健喃喃道：“天地震怒，世界麵臨毀滅的時候，海之神將會出現，與優秀的控製者一起平息眾神的怒氣。原來竟然是這個意思！”
一切平息後，洛奇亞帶著三聖鳥來到了亞西亞島的海邊。
“小智謝謝你！”洛奇亞降落到了小智身邊。
小智笑道：“洛奇亞你不用客氣！”
洛奇亞道：“要不是你的話，災難造成地影響會是巨大的。真不愧是鳳王那個家夥選中的人啊！”
“小智謝謝你！”三聖鳥也降落在了洛奇亞身後。
小智道：“你們這麽說，我都不好意思了！好了，這些都是我應該做的事！”
【劇情任務洛奇亞的爆誕已完成，劇情任務獎勵積分，觸發支線任務，收服三聖鳥。完成支線任務後，剩下的獎勵才會發放。】
洛奇亞道：“小智，這是我們的謝禮！”洛奇亞發出了一道藍光沒入了小智的身體中。
【恭喜宿主得到海之神洛奇亞的賜福，獲得海神使者的稱號。等宿主到達圓朱市和漩渦列島後，鳳王使者和海神使者的稱號將發揮作用。】
“到我們了！”三聖鳥道。
火焰鳥道：“小智，我們三個就送你三隻我們族群中的優秀後輩吧！相信跟著你，它們都會有所成長的。閃電鳥的後輩在黑雲市附近的發電站，急凍鳥的後輩在雙子島的深處，而我的後輩則是在燈火山。”
小智道謝道：“我也要謝謝你們！”
三聖鳥回到了屬於各自的小島之上，洛奇亞則回到了海洋深處繼續沉睡。
通信裝置再次響起，渡的聲音傳來：“小智，那個自稱謎之收藏家的家夥已經被我逮捕了，聯盟的消息海流已經恢複到平常的水平的，這件事算是平安解決了！”
小智道：“那就好！”
渡道：“我向聯盟申請了對你的獎勵，我會派人送到真新鎮的。我還要處理接下來的事情，我就先掛了！”
小智道：“好。”
通信裝置被掛斷。
完成了亞西亞島的慶典後，第二天小智一行人繼續前往橘子聯盟的最後一個道館榴柑島。
吉爾露太看到超夢開心道：“沒想到你居然有人造寶可夢超夢啊！還真是意外之喜，雖然讓閃電鳥跑了，但我隻需要再去抓一次就行了！”
小智問道：“既然都被你抓了，我想知道你抓三聖鳥的目的是不是海之神洛奇亞呢？”
吉爾露太大笑道：“沒錯！收藏家要做的就是將自己的藏品展示出來，三聖鳥和洛奇亞就是目對我而言最好的收藏品，對了小弟弟還要加上你的超夢。”吉爾露太按下了一個按鈕，小智從特製的籠子裏放了出來。
吉爾露太道：“你是多餘的，就讓你在這裏盡情欣賞我的收藏品吧！不過可不能用手碰哦！這可是基本的禮節。”
吉爾露太笑著滿意的離開了！
小智站了起來，露出了一個狡黠的笑容，太自信就是吉爾露太的致命弱點，他拿出了夢幻的大師球：“夢幻就決定是你了！”
“咪嗚！”小智我在精靈球裏都聽到了。
小智之前的z手環在大木博士那裏，他之後又花了的積分兌換了三個，準備給夥伴們用，沒想到現在有了用武之地。他從係統背包中拿出了其中一個z手環，更換上了夢幻z。
“上吧！夢幻！瞄準那個黑色圓環，使用起源超新星大爆炸！”
“咪嗚！”夢幻的專屬z招式命中了黑色圓環。
超夢在黑色圓環碎裂的時候，使用了精神擊破直接脫困。小智假裝被抓住，就是要趁機將火焰鳥救出來。
小智焦急道：“火焰鳥你沒事吧！”
“我沒事，隻是被吸走了太多的力量了，現在沒有力氣。”火焰鳥用心電感應對小智說道。
【火焰鳥】
【屬性：火、飛行】
【特性：壓迫感（給予對手壓迫感，大量減少其使用的招式的pp）】
【實力：神獸級（神職）】
小智跟124號兌換了一個可以恢複火係寶可夢體力的能量方塊。火焰鳥吃下後，精神了不少，124號出品必是精品，效果很是明顯。
“咪嗚。”小智你看外麵。
小智抬頭看去，透過飛行器的玻璃，外麵竟然開始下暴風雪了！
“夢幻用你的瞬間移動我們去冰之島！”
“咪嗚！”好的！
夢幻的瞬間移動包裹住小智、皮卡丘、超夢以及火焰鳥，眼前的景物一閃就到了冰之島上空。
小智的身體在猛地下墜，火焰鳥將其托在了背上。
小智對夢幻和超夢道：“你們都先回來吧！”隨即小智對火焰鳥道：“火焰鳥帶我先去找我的同伴吧！”
“坐穩了！”火焰鳥加快了速度。
這時，小智的通信裝置響了起來，渡道：“小智，你那邊情況怎麽樣了？”
小智道：“渡先生，我將火焰鳥救出來了！”
渡道：“具體的我們等事情結束再說，我遇到你的同伴們了，我去拿冰之島的寶藏，雷之島的寶藏就交給你了！”
小智道：“好，渡先生我們在亞西亞島見。”
小智掛斷了通信裝置，對火焰鳥道：“火焰鳥我們轉道去雷之島。”
冰之島附近被困在結凍海麵上的小霞等人，聽到渡得到了小智的消息後都鬆了口氣。渡對眾人道：“我現在去拿冰之島的寶藏，火焰鳥已經被小智救了出來。”
小智這邊也在雷之島上拿到了寶藏，火焰鳥突然向身後使用了噴射火焰，失去理智的急凍鳥使用了急凍光線對抗火焰鳥的噴射火焰。
【急凍鳥】
【屬性：冰、飛行】
【特性：壓迫感（給予對手壓迫感，大量減少其使用的招式的pp）】
【實力：神獸級（神職）】
火焰鳥道：“小智你快走！我和閃電鳥的力量都被吸走了大半，我擋不住急凍鳥的，你先回亞西亞島！”
小智擔心道：“火焰鳥，你撐的住嗎？”
火焰鳥道：“時間不長，應該問題不大。小智你是那位大人選中的訓練家，這件事隻有你能去辦，你先回亞西亞島。海底的另外一個大人也快醒了！我隻需要拖住一時半刻就行了！”
小智道：“好，我能感覺到閃電鳥也在趕過來的路上了。”小智抱上皮卡丘，坐在了大嘴雀的背上，就先離開了。
火焰鳥說的對，要想讓急凍鳥平靜下來，必須將寶藏放到它們應該在的地方。在三分鍾後，閃電鳥也趕到了，三聖鳥在空中纏鬥在了一起，但閃電鳥和火焰鳥的力量明顯被急凍鳥給壓製著。
突然一道衝天的海流攔在了三聖鳥的中間，是洛奇亞。洛奇亞終於也醒了！
【洛奇亞】
【屬性：超能、飛行】
【特性：壓迫感（給予對手壓迫感，大量減少其使用的招式的pp）】
【實力：神獸級（神職）】
悠揚的笛聲在這個時候響起，這是芙盧拉？
小智看見了小剛駕駛著船朝小智的方向駛來，小智跳到了甲板上，小霞關心道：“小智你沒事吧！”
小智搖了搖頭：“我沒事！果然跟傳說一樣，芙盧拉的笛子有安撫眾神的作用。”
芙盧拉的笛子讓戰鬥的場麵平緩了不少。
渡的聲音傳來：“小智，接住！我還要去逮捕那個謎之收藏家。”小智伸手將東西接住，這下三個寶藏集齊了。渡調轉了方向，去追逃跑的吉爾露太。
小剛也加大了馬力，朝亞西亞島趕了回去。
二十分鍾後，小智一行人趕往神殿。小智將三顆珠子放在了對應的位置後，朝芙盧拉點了點頭，芙盧拉悠揚的笛聲再次響起，這次天空中的雷雲開始消散，暴風雪也停止了，急凍鳥也慢慢地平靜了下來。
小健喃喃道：“天地震怒，世界麵臨毀滅的時候，海之神將會出現，與優秀的控製者一起平息眾神的怒氣。原來竟然是這個意思！”
一切平息後，洛奇亞帶著三聖鳥來到了亞西亞島的海邊。
“小智謝謝你！”洛奇亞降落到了小智身邊。
小智笑道：“洛奇亞你不用客氣！”
洛奇亞道：“要不是你的話，災難造成地影響會是巨大的。真不愧是鳳王那個家夥選中的人啊！”
“小智謝謝你！”三聖鳥也降落在了洛奇亞身後。
小智道：“你們這麽說，我都不好意思了！好了，這些都是我應該做的事！”
【劇情任務洛奇亞的爆誕已完成，劇情任務獎勵積分，觸發支線任務，收服三聖鳥。完成支線任務後，剩下的獎勵才會發放。】
洛奇亞道：“小智，這是我們的謝禮！”洛奇亞發出了一道藍光沒入了小智的身體中。
【恭喜宿主得到海之神洛奇亞的賜福，獲得海神使者的稱號。等宿主到達圓朱市和漩渦列島後，鳳王使者和海神使者的稱號將發揮作用。】
“到我們了！”三聖鳥道。
火焰鳥道：“小智，我們三個就送你三隻我們族群中的優秀後輩吧！相信跟著你，它們都會有所成長的。閃電鳥的後輩在黑雲市附近的發電站，急凍鳥的後輩在雙子島的深處，而我的後輩則是在燈火山。”
小智道謝道：“我也要謝謝你們！”
三聖鳥回到了屬於各自的小島之上，洛奇亞則回到了海洋深處繼續沉睡。
通信裝置再次響起，渡的聲音傳來：“小智，那個自稱謎之收藏家的家夥已經被我逮捕了，聯盟的消息海流已經恢複到平常的水平的，這件事算是平安解決了！”
小智道：“那就好！”
渡道：“我向聯盟申請了對你的獎勵，我會派人送到真新鎮的。我還要處理接下來的事情，我就先掛了！”
小智道：“好。”
通信裝置被掛斷。
完成了亞西亞島的慶典後，第二天小智一行人繼續前往橘子聯盟的最後一個道館榴柑島。