小智一行人以對戰水管為目標繼續著旅行，剛好遇上了淺紅市舉辦華麗大賽，小智順利奪得了他的第三枚緞帶勳章。
現在幾人正在淺紅市外的森林中略作休息。
小遙抱著她的精靈蛋細心的擦拭著，期待道：“不知道我的精靈蛋什麽時候才能孵化出來，真是有些迫不及待了！”
小剛道：“按照時間看，估計差不多了！”
小勝道：“就不知道是什麽寶可夢了？是水係的呢？還是火係的呢？”
小遙興奮道：“不管是什麽，隻要平安出生就好。”
小智笑笑，他早就知道小遙的精靈蛋中是伊布，隻是這個謎題還是等孵化的時候在揭曉吧！皮卡丘和利歐路一隻一邊的坐在小智的腿上吃著點心，他摸了摸兩隻的頭，利歐路這麽開心就已經很好了。
“利歐利歐。”利歐路的耳朵忽然浮了起來，指著不遠處的一塊岩石說著。
小智道：“是個人類，沒關係的。”
“利歐利歐。”利歐路就放心地繼續吃著蛋糕。
小剛驚訝地看著小智，問道：“小智剛才利歐路說的你能聽懂？”
小遙與小勝也同時抬起頭，看向小智。小智解釋道：“自從利歐路誕生之後，我就現我能明白寶可夢的意思了。”
小智總不能說自己開掛了吧！
小剛道：“原來如此！利歐路的波導本來就和小智的契合度很高，你們兩個在一起或許是覺醒了某種神奇的力量也不一定。”
小勝道：“這種事情真的有可能嗎？”
小遙道：“小勝你笨啊！小智這個例子就好好的站在我們麵前啊！”
小智道：“那邊岩石中的人，快出來吧！我們已經發現你了！”
岩石突然炸開，從中登場了一個身著藍色忍者服的少年，他還帶著一隻脫殼忍者。
少年不好意思的走上前，道：“我還以為諸位是在這附近搗亂的可疑人物呢！真的不好意思，所以我才會在岩石裏監視諸位的。我叫比久，是寶可夢忍者學院的學生。”
小智四人也紛紛自我介紹道。
小勝感興趣道：“寶可夢忍者學院？”
比久解釋道：“就是與寶可夢一起做忍者修行的學院，如果你們感興趣的話可以去參加一天的體驗入學。”
小遙也極為感興趣道：“聽起來很有意思哎！”
小智問道：“比久，你剛才說在附近搗亂的可疑人員是怎麽回事？”
比久道：“森林附近有很多種植藍橘的田地，這幾天晚上都有人目擊到有可疑的人來偷藍橘，等到追過去的時候，人影就鑽進了森林失去了蹤跡。在下的一個同學今早還說他追過去的時候還聽到了哭聲。”
小剛道：“這麽說來是真的挺可疑的。”
小智四人跟著比久來到森林中央的一座傳統建築更換上了忍者服，參加一日的體驗入學。
負責教學的老師是個年輕的女生，她道：“今天按照計劃是在森林中進行修行哦！不過大家要注意安全哦！”
小剛趁小勝一個不注意就犯病了，朝那個女生撲了上去：“好好好！”
那個女生尷尬道：“你叫小剛對吧！是來參加一日體驗的？”
小剛花癡道：“太感動了！沒想到，你這麽快就記住小生的名字了！小生能成為市子老師這麽漂亮的人的學生，真是太太太太幸福了！”說著小剛就抱住了市子。
小剛覺察到手感不對，硬硬的。小剛驚訝的往後退，這麽一個漂亮的女生居然變成了一根木頭。
市子已經站在一旁的樹枝上道：“怎麽樣？這就是替身之術哦！小剛你的修行可不能掉以輕心哦！”
小剛失落道：“是。”
市子帶領著眾人到了一個池塘裏，一人給了一個可供呼吸的竹管。小勝和小遙堅持了3分鍾就浮出了水麵。市子拍手道：“可以了！”
眾人才陸續浮出水麵。
市子講解道：“水遁之術的要領，在於讓自己與池塘同化，一定要相信自己就是水，才能成功。”
接下來就是尋找隱身的變隱龍，有一個胖胖的學生，沒有抓住變隱龍，卻抓住了一隻愛哭樹，這隻愛哭樹因為害怕而大哭了起來。
“啊，這跟昨晚我聽到的哭聲一樣！”
“這麽說偷走我家藍橘的就是它嘍！”
眾人被吸引了過去，小剛將愛哭樹抱了過去：“先等等，你們看它怕成這樣，乖乖！”
愛哭樹被小剛哄好了。小智道：“犯人應該不是這隻愛哭樹哦！”
那個學生道：“可是昨晚我明明聽到一樣的哭聲啊！”
小智和小剛都看出來了，這隻愛哭樹其實還沒有出生多久，連稍微硬一些的寶可夢食物都吃不了，更何況是外殼堅硬的藍橘了。
小剛道：“我來證明吧！”小剛摘下了一顆藍橘放到了愛哭樹的嘴邊，愛哭樹搖頭拒絕。小剛不知道從哪裏拿出來的奶瓶，再次喂給愛哭樹吃，愛哭樹這次沒有拒絕，大口大口的喝著牛奶。
突如其來的一個大手裏劍，朝眾人飛來，小智無奈道：“都退後，犯人來了！皮卡丘，用鐵尾將手裏劍打回去。”
皮卡丘從小智肩上躍起，一擊鐵尾就將手裏劍打了回去，不偏不倚插在了火箭隊製作的機器人上，電光四射，火箭隊三人急忙從機器人上下來，才沒有被炸飛。
小智道：“偷吃藍橘的是不是你們！”
武藏道：“小鬼頭你是怎麽知道的，我們這兩天為了省夥食費嘛！”
小次郎道：“我們最近資金很緊張啊！”
喵喵道：“剛好我們看見有藍橘就起了打算了喵！”
小剛嚴肅道：“不可原諒！愛哭樹差點被你們幾個連累！沼躍魚，出來吧！使用水波動，打飛他們幾個！”
沼躍魚的水球投向火箭隊，不出意外的原地起飛。
“好討厭的感覺啊！”
“索南斯！”
“瑪奈奈！”
小剛的沼躍魚終於到了進化的時刻，進化成了最終進化型的巨沼怪。
“胡說胡說。”愛哭樹突然撞了一下小剛。
小智替愛哭樹翻譯道：“它希望小剛收服它！”
小剛看向懷中的愛哭樹道：“是這樣嗎？愛哭樹。”
“胡說胡說。”愛哭樹用它的頭連續撞著小剛。
小智繼續翻譯道：“打贏它才可以哦！”
小剛笑道：“這樣啊！好吧！巨沼怪你先回來吧，佛烈托斯換你上場了！”
愛哭樹開始對戰就使用了假哭，突如其來的撞擊命中了佛烈托斯。
“高速旋轉！”
佛烈托斯使用了高速旋轉將愛哭樹撞飛了出去。
“用隱形岩封住愛哭樹的行動。”
無數岩石懸浮在愛哭樹的周圍，讓它無法移動。小剛趁機扔出了精靈球，完成了收服。
小剛這個前尼比道館的訓練家，終於收服了一隻岩石係的愛哭樹，並當起了它的奶爸。
小智一行人完成在寶可夢忍者學院修行的一日體驗後，繼續朝向對戰水管前進。
現在幾人正在淺紅市外的森林中略作休息。
小遙抱著她的精靈蛋細心的擦拭著，期待道：“不知道我的精靈蛋什麽時候才能孵化出來，真是有些迫不及待了！”
小剛道：“按照時間看，估計差不多了！”
小勝道：“就不知道是什麽寶可夢了？是水係的呢？還是火係的呢？”
小遙興奮道：“不管是什麽，隻要平安出生就好。”
小智笑笑，他早就知道小遙的精靈蛋中是伊布，隻是這個謎題還是等孵化的時候在揭曉吧！皮卡丘和利歐路一隻一邊的坐在小智的腿上吃著點心，他摸了摸兩隻的頭，利歐路這麽開心就已經很好了。
“利歐利歐。”利歐路的耳朵忽然浮了起來，指著不遠處的一塊岩石說著。
小智道：“是個人類，沒關係的。”
“利歐利歐。”利歐路就放心地繼續吃著蛋糕。
小剛驚訝地看著小智，問道：“小智剛才利歐路說的你能聽懂？”
小遙與小勝也同時抬起頭，看向小智。小智解釋道：“自從利歐路誕生之後，我就現我能明白寶可夢的意思了。”
小智總不能說自己開掛了吧！
小剛道：“原來如此！利歐路的波導本來就和小智的契合度很高，你們兩個在一起或許是覺醒了某種神奇的力量也不一定。”
小勝道：“這種事情真的有可能嗎？”
小遙道：“小勝你笨啊！小智這個例子就好好的站在我們麵前啊！”
小智道：“那邊岩石中的人，快出來吧！我們已經發現你了！”
岩石突然炸開，從中登場了一個身著藍色忍者服的少年，他還帶著一隻脫殼忍者。
少年不好意思的走上前，道：“我還以為諸位是在這附近搗亂的可疑人物呢！真的不好意思，所以我才會在岩石裏監視諸位的。我叫比久，是寶可夢忍者學院的學生。”
小智四人也紛紛自我介紹道。
小勝感興趣道：“寶可夢忍者學院？”
比久解釋道：“就是與寶可夢一起做忍者修行的學院，如果你們感興趣的話可以去參加一天的體驗入學。”
小遙也極為感興趣道：“聽起來很有意思哎！”
小智問道：“比久，你剛才說在附近搗亂的可疑人員是怎麽回事？”
比久道：“森林附近有很多種植藍橘的田地，這幾天晚上都有人目擊到有可疑的人來偷藍橘，等到追過去的時候，人影就鑽進了森林失去了蹤跡。在下的一個同學今早還說他追過去的時候還聽到了哭聲。”
小剛道：“這麽說來是真的挺可疑的。”
小智四人跟著比久來到森林中央的一座傳統建築更換上了忍者服，參加一日的體驗入學。
負責教學的老師是個年輕的女生，她道：“今天按照計劃是在森林中進行修行哦！不過大家要注意安全哦！”
小剛趁小勝一個不注意就犯病了，朝那個女生撲了上去：“好好好！”
那個女生尷尬道：“你叫小剛對吧！是來參加一日體驗的？”
小剛花癡道：“太感動了！沒想到，你這麽快就記住小生的名字了！小生能成為市子老師這麽漂亮的人的學生，真是太太太太幸福了！”說著小剛就抱住了市子。
小剛覺察到手感不對，硬硬的。小剛驚訝的往後退，這麽一個漂亮的女生居然變成了一根木頭。
市子已經站在一旁的樹枝上道：“怎麽樣？這就是替身之術哦！小剛你的修行可不能掉以輕心哦！”
小剛失落道：“是。”
市子帶領著眾人到了一個池塘裏，一人給了一個可供呼吸的竹管。小勝和小遙堅持了3分鍾就浮出了水麵。市子拍手道：“可以了！”
眾人才陸續浮出水麵。
市子講解道：“水遁之術的要領，在於讓自己與池塘同化，一定要相信自己就是水，才能成功。”
接下來就是尋找隱身的變隱龍，有一個胖胖的學生，沒有抓住變隱龍，卻抓住了一隻愛哭樹，這隻愛哭樹因為害怕而大哭了起來。
“啊，這跟昨晚我聽到的哭聲一樣！”
“這麽說偷走我家藍橘的就是它嘍！”
眾人被吸引了過去，小剛將愛哭樹抱了過去：“先等等，你們看它怕成這樣，乖乖！”
愛哭樹被小剛哄好了。小智道：“犯人應該不是這隻愛哭樹哦！”
那個學生道：“可是昨晚我明明聽到一樣的哭聲啊！”
小智和小剛都看出來了，這隻愛哭樹其實還沒有出生多久，連稍微硬一些的寶可夢食物都吃不了，更何況是外殼堅硬的藍橘了。
小剛道：“我來證明吧！”小剛摘下了一顆藍橘放到了愛哭樹的嘴邊，愛哭樹搖頭拒絕。小剛不知道從哪裏拿出來的奶瓶，再次喂給愛哭樹吃，愛哭樹這次沒有拒絕，大口大口的喝著牛奶。
突如其來的一個大手裏劍，朝眾人飛來，小智無奈道：“都退後，犯人來了！皮卡丘，用鐵尾將手裏劍打回去。”
皮卡丘從小智肩上躍起，一擊鐵尾就將手裏劍打了回去，不偏不倚插在了火箭隊製作的機器人上，電光四射，火箭隊三人急忙從機器人上下來，才沒有被炸飛。
小智道：“偷吃藍橘的是不是你們！”
武藏道：“小鬼頭你是怎麽知道的，我們這兩天為了省夥食費嘛！”
小次郎道：“我們最近資金很緊張啊！”
喵喵道：“剛好我們看見有藍橘就起了打算了喵！”
小剛嚴肅道：“不可原諒！愛哭樹差點被你們幾個連累！沼躍魚，出來吧！使用水波動，打飛他們幾個！”
沼躍魚的水球投向火箭隊，不出意外的原地起飛。
“好討厭的感覺啊！”
“索南斯！”
“瑪奈奈！”
小剛的沼躍魚終於到了進化的時刻，進化成了最終進化型的巨沼怪。
“胡說胡說。”愛哭樹突然撞了一下小剛。
小智替愛哭樹翻譯道：“它希望小剛收服它！”
小剛看向懷中的愛哭樹道：“是這樣嗎？愛哭樹。”
“胡說胡說。”愛哭樹用它的頭連續撞著小剛。
小智繼續翻譯道：“打贏它才可以哦！”
小剛笑道：“這樣啊！好吧！巨沼怪你先回來吧，佛烈托斯換你上場了！”
愛哭樹開始對戰就使用了假哭，突如其來的撞擊命中了佛烈托斯。
“高速旋轉！”
佛烈托斯使用了高速旋轉將愛哭樹撞飛了出去。
“用隱形岩封住愛哭樹的行動。”
無數岩石懸浮在愛哭樹的周圍，讓它無法移動。小剛趁機扔出了精靈球，完成了收服。
小剛這個前尼比道館的訓練家，終於收服了一隻岩石係的愛哭樹，並當起了它的奶爸。
小智一行人完成在寶可夢忍者學院修行的一日體驗後，繼續朝向對戰水管前進。