另一邊的小智三人抵達了龍螺旋之塔。
艾莉絲感歎道：“近看真的很雄偉啊！”
天桐解釋道：“龍螺旋之塔是合眾地區最古老的塔，但是誰建造的，什麽時候建的卻是未知數哦！”
這時，一輛越野車朝小智三人這邊駛來，駕駛員打招呼道：“hi，你們好啊！小智博士就是you嗎？”
小智道：“沒錯！”
駕駛員自稱叫尼克，是老紅豆杉博士的助手。隨後，他就邀請了小智三人上車。
小智看著這偽裝，道：“帥哥先生，你這風格還是挺多變的啊！”
原來他就是國際刑警的帥哥先生，帥哥笑道：“還是瞞不過你啊！小智搜查官，根據我們的情報，等離子團會提前行動，所以我連夜趕來這裏的，沒想到你們就晚了我一天的時間。”
小智道：“這都是n先生的功勞，他送我們過來的。對了，白色遺跡的挖掘工作進行到什麽程度了？有發現什麽嗎？”
帥哥道：“光明石！”
“光明石？！”
小智道：“果然在白色遺跡發現了光明石了，但是據我所知萊希拉姆的光明石在艾因多奧克兩年多前曾經失竊過，但後來又被一個德雷多的人送了回去，那麽現在白色遺跡中的光明石是怎麽回事？”
艾莉絲也奇怪道：“老師說得對，大婆婆和夏卡給老師的火焰光明石就是萊希拉姆的力量本源了，那麽又怎麽會多出一顆光明石呢？”
天桐道：“看樣子我們要親眼見到光明石才能知道事情的真相了。”
帥哥道：“這麽說萊希拉姆的光明石在小智搜查官你的身上了？”
小智道：“捷克羅姆、萊希拉姆和酋雷姆都在我這裏！”
帥哥沒有繼續問，隻是駕駛著越野車往老紅豆杉博士現在的挖掘營地而去。下了車後，三人跟著帥哥很順利的進入到了白色遺跡中，搬運小匠、修繕老頭和泥偶巨人等都在和工作人員一起進行挖掘工作。
帥哥道：“我帶你們去找博士吧！往這邊走！”
小智四人繞過了前麵的挖掘場地，來到了一個山洞，進入後這裏才是白色遺跡的真正發現地點。
帥哥邊帶路邊介紹道：“雖然還沒有掌握整體結構，但是在目前發現的遺跡之中，這座白色遺跡可是最大的！”
艾莉絲道：“要是沒有人帶路這些通道就是個迷宮啊！”
小智三人見到了老紅豆杉博士，他此時正在一堵刻有古代文字的牆前記錄著什麽。老紅豆杉博士嚴肅道：“你們不可以再靠近這裏了！”
小智四人停住了腳步，有什麽機關嗎？小智將波導之力散出去，卻什麽都沒有發現。
他緊接著又道：“其實靠近也沒關係啦！”
眾人無語！
艾莉絲道：“博士您還是像以前一樣，說話愛繞圈子！”
三人都差點忘記了老紅豆杉博士說話的方式了。
老紅豆杉博士笑道：“還記得我說過的冒險心得的第一條是什麽嗎？”
天桐道：“好像是別人說的話要聽到最後吧！”
老紅豆杉博士道：“沒錯！小智博士，辛苦你們長途跋涉趕來了！小智你先看看那道門，針對這裏的壁畫配合古代文字的解讀，我們已經確定了這裏頭確實是萊希拉姆的遺跡。你們看這裏，中間的石台上放著的就是這個光明石。”
小智接過光明石，入手的感覺就不一樣，道：“這隻是個贗品，應該是祭祀用的替代品，有一部分萊希拉姆留下的力量。”
老紅豆杉博士道：“果然如此但也很有研究的價值。在寶可夢神話白之章中記載，在人類的曆史中，如果出現了追求真實的人物，萊希拉姆就會現身。”
“首先，萊希拉姆會與此人交戰，測試他的心靈與力量，然後當萊希拉姆認定此人是英雄的話，他將會傳授積蓄了好幾千年的知識給英雄，並對英雄的敵人刀刃相向，之後，萊希拉姆會像母親一般的溫柔態度對待英雄。”
“但是，被稱為英雄的人因為得到了巨大的財富與權力，最終導致他失去了善良的心......”
“於是再用火焰將英雄一手創造的國家燃燒殆盡後，萊希拉姆從此離去！”最後這句話是趕來的n所說的。
小智道：“原來事情的真相是這樣，魁奇思曾經也得到過萊希拉姆的認可啊！要不然他不會這麽執著的讓n先生你得到萊希拉姆的認可。等離子團的人已經快到了嗎？”
n道：“是的！小智，剛才的那顆是光明石嗎？”
小智搖了搖頭道：“不是真的，但也有召喚萊希拉姆的力量。不過時間太久遠，基本上這個能力已經微乎其微，萊希拉姆現在在我這裏，就算能召喚也是徒勞的。”
n道：“那就好！”
小智道：“既然等離子團已經快到了，我有個計劃......”
小智的計劃就是用這顆光明石的替代品引魁奇思出現。
不多時，等離子團的安潔帶隊就將整個發掘營地給包圍了。老紅豆杉博士將光明石護在懷中，艾莉絲和天桐保護著他走出了遺跡。
此時阿克羅瑪已經操縱控製寶可夢的裝置將在白色遺跡進行工作的泥偶巨人和修繕老頭等寶可夢都控製住了。
安潔道：“搜查官我們又見麵了，還有n也是，將光明石交給我們！”
小智道：“有我在，可沒有這麽簡單！”
艾莉絲和天桐道：“還有我們呢！”
“出來吧，快龍！”
“上場了，我最優秀的岩殿居蟹！”
小智道：“那我這邊就......達克萊伊就決定是你了！”
阿克羅瑪將裝置對準了達克萊伊、快龍以及岩殿居蟹，小智道：“快點將快龍和岩殿居蟹收回去！”
阿克羅瑪的目標一開始就是達克萊伊，被光線射中後，就猩紅著雙眼看著小智。
阿克羅瑪笑道：“到此為止了！”
小智等人被等離子團的人以及寶可夢們團團圍住，等離子團用繩子將眾人都綁了起來。就在此時，魁奇思乘坐著飛行器來到了眾人的眼前。
魁奇思大笑道：“不愧是阿克羅瑪博士製造的機器，連神獸都能控製了！小智搜查官，之前你讓我的下屬給我帶的話，我現在都還給你。忘記了自我介紹了，我就是等離子團的首領魁奇思！”
n憤怒道：“魁奇思難道你又要犯兩年前的錯誤了嗎？你也看到了，召喚萊希拉姆的時候，發生了多麽可怕的事情！”
魁奇思道：“我不會重蹈覆轍的！我現在已經擁有了寶可夢控製機和光明石，你阻止不了我的！”
魁奇思大手一揮，召喚儀式開始。隨著火焰升空，整個祭台變為了火焰的鮮紅色，陣法的紋路逐漸清晰。
隻是動靜越大失望越大，小智無聊的打了哈欠道：“魁奇思，話說萊希拉姆呢？”
魁奇思難以置信道：“不可能啊！那麽就再加上這個！”魁奇思拿出了一個黑白相間的三角體，最前端有個黃色的尖刺，這就是基因之楔。魁奇思將基因之楔放在了光明石的旁邊。
小智道：“瑪夏多就是現在！”
從石台的影子中，瑪夏多現身了，它以迅雷不及掩耳之勢將基因之楔給搶了過來，等魁奇思反應過來的時候，基因之楔已經在小智的手裏了。
小智拿出了一個大師球，道：“妄想控製神獸，說出來也挺搞笑的。靠那個機器啊，再花十年的時間也是白搭。達克萊伊動手使用黑洞！對了，忘記告訴你了，達克萊伊是裝的！”
達克萊伊一個巨大的黑洞就讓被控製的寶可夢和等離子團的成員都陷入了噩夢中。隻剩了下一個魁奇思和阿克羅瑪，阿克羅瑪那邊還有火箭隊三人要去報仇呢，小智根本不用擔心，他把玩著手裏的大師球和基因之楔道：“接下來就是你的複仇時刻了！酋雷姆，就決定是你了！”
酋雷姆將基因之楔融入了體內道：“小智謝謝你！魁奇思，我的力量本源好用嗎？”
酋雷姆步步緊逼魁奇思。
小智讓達克萊伊用精神強念將眾人身上的繩子都弄斷，n道：“小智，為什麽達克萊伊沒有被控製啊！”
小智解釋道：“我的達克萊伊可是跟帕魯奇亞和帝牙盧卡對戰過的，先不說它的實力很強，這種機器控製一般的寶可夢沒問題，但是神獸的數據可是沒有，而且神獸每一隻都不簡單！想要控製它們當作兵器，是不可能成功的！計劃也來到了最後了！”
魁奇思道：“可惡！”
小智道：“結束了哦！酋雷姆，轉變形態，使用冰凍伏特！”
小智話音剛落，暗黑酋雷姆登場，當然隻有魁奇思一個人被永久冰封，這種狀態他死不了也無法擺脫冰封了。
阿克羅瑪被火箭隊的三人綁了起來，機器則是被趕來的荷蓮娜和巴貝娜給毀了。火箭隊知道這機器不能控製神獸也對此沒有了興趣，毀了就毀了。
巨大的爆炸聲響起，控製寶可夢的裝置直接被毀去。達克萊伊解除了黑洞的控製，寶可夢們都恢複了原狀。帥哥先生提前聯係的君莎小姐以及國際刑警將等離子團全部打包帶走，又一個邪惡組織在小智的手上終結！
酋雷姆重新獲得了自己的本源力量後就回到了精靈球中，當初跟隨小智也隻是單純認可了這個人類訓練家，現在是真正的認定了他就是自己的訓練家了。
等離子團的覆滅，壓在n與荷蓮娜和巴貝娜身上的枷鎖也就消失了，n邀請道：“荷蓮娜，巴貝娜，跟我一起去看看霧以外的世界吧！跟我一起去旅行，在這個現實的世界旅行！”
荷蓮娜道：“要往哪裏去呢？”
n道：“往理想的地方去！我想要找到將理想變為現實，自己能做到的事情！我需要你們的力量！”
n與荷蓮娜與巴貝娜去旅行了，為了實現人類理想的世界，小智三人目送他們離開，相信以後在某處還會再次相遇！
至於老紅豆杉博士聽說發現了新的冰之遺跡後，帶著挖掘隊的成員們馬不停蹄的離開......
艾莉絲感歎道：“近看真的很雄偉啊！”
天桐解釋道：“龍螺旋之塔是合眾地區最古老的塔，但是誰建造的，什麽時候建的卻是未知數哦！”
這時，一輛越野車朝小智三人這邊駛來，駕駛員打招呼道：“hi，你們好啊！小智博士就是you嗎？”
小智道：“沒錯！”
駕駛員自稱叫尼克，是老紅豆杉博士的助手。隨後，他就邀請了小智三人上車。
小智看著這偽裝，道：“帥哥先生，你這風格還是挺多變的啊！”
原來他就是國際刑警的帥哥先生，帥哥笑道：“還是瞞不過你啊！小智搜查官，根據我們的情報，等離子團會提前行動，所以我連夜趕來這裏的，沒想到你們就晚了我一天的時間。”
小智道：“這都是n先生的功勞，他送我們過來的。對了，白色遺跡的挖掘工作進行到什麽程度了？有發現什麽嗎？”
帥哥道：“光明石！”
“光明石？！”
小智道：“果然在白色遺跡發現了光明石了，但是據我所知萊希拉姆的光明石在艾因多奧克兩年多前曾經失竊過，但後來又被一個德雷多的人送了回去，那麽現在白色遺跡中的光明石是怎麽回事？”
艾莉絲也奇怪道：“老師說得對，大婆婆和夏卡給老師的火焰光明石就是萊希拉姆的力量本源了，那麽又怎麽會多出一顆光明石呢？”
天桐道：“看樣子我們要親眼見到光明石才能知道事情的真相了。”
帥哥道：“這麽說萊希拉姆的光明石在小智搜查官你的身上了？”
小智道：“捷克羅姆、萊希拉姆和酋雷姆都在我這裏！”
帥哥沒有繼續問，隻是駕駛著越野車往老紅豆杉博士現在的挖掘營地而去。下了車後，三人跟著帥哥很順利的進入到了白色遺跡中，搬運小匠、修繕老頭和泥偶巨人等都在和工作人員一起進行挖掘工作。
帥哥道：“我帶你們去找博士吧！往這邊走！”
小智四人繞過了前麵的挖掘場地，來到了一個山洞，進入後這裏才是白色遺跡的真正發現地點。
帥哥邊帶路邊介紹道：“雖然還沒有掌握整體結構，但是在目前發現的遺跡之中，這座白色遺跡可是最大的！”
艾莉絲道：“要是沒有人帶路這些通道就是個迷宮啊！”
小智三人見到了老紅豆杉博士，他此時正在一堵刻有古代文字的牆前記錄著什麽。老紅豆杉博士嚴肅道：“你們不可以再靠近這裏了！”
小智四人停住了腳步，有什麽機關嗎？小智將波導之力散出去，卻什麽都沒有發現。
他緊接著又道：“其實靠近也沒關係啦！”
眾人無語！
艾莉絲道：“博士您還是像以前一樣，說話愛繞圈子！”
三人都差點忘記了老紅豆杉博士說話的方式了。
老紅豆杉博士笑道：“還記得我說過的冒險心得的第一條是什麽嗎？”
天桐道：“好像是別人說的話要聽到最後吧！”
老紅豆杉博士道：“沒錯！小智博士，辛苦你們長途跋涉趕來了！小智你先看看那道門，針對這裏的壁畫配合古代文字的解讀，我們已經確定了這裏頭確實是萊希拉姆的遺跡。你們看這裏，中間的石台上放著的就是這個光明石。”
小智接過光明石，入手的感覺就不一樣，道：“這隻是個贗品，應該是祭祀用的替代品，有一部分萊希拉姆留下的力量。”
老紅豆杉博士道：“果然如此但也很有研究的價值。在寶可夢神話白之章中記載，在人類的曆史中，如果出現了追求真實的人物，萊希拉姆就會現身。”
“首先，萊希拉姆會與此人交戰，測試他的心靈與力量，然後當萊希拉姆認定此人是英雄的話，他將會傳授積蓄了好幾千年的知識給英雄，並對英雄的敵人刀刃相向，之後，萊希拉姆會像母親一般的溫柔態度對待英雄。”
“但是，被稱為英雄的人因為得到了巨大的財富與權力，最終導致他失去了善良的心......”
“於是再用火焰將英雄一手創造的國家燃燒殆盡後，萊希拉姆從此離去！”最後這句話是趕來的n所說的。
小智道：“原來事情的真相是這樣，魁奇思曾經也得到過萊希拉姆的認可啊！要不然他不會這麽執著的讓n先生你得到萊希拉姆的認可。等離子團的人已經快到了嗎？”
n道：“是的！小智，剛才的那顆是光明石嗎？”
小智搖了搖頭道：“不是真的，但也有召喚萊希拉姆的力量。不過時間太久遠，基本上這個能力已經微乎其微，萊希拉姆現在在我這裏，就算能召喚也是徒勞的。”
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小智道：“既然等離子團已經快到了，我有個計劃......”
小智的計劃就是用這顆光明石的替代品引魁奇思出現。
不多時，等離子團的安潔帶隊就將整個發掘營地給包圍了。老紅豆杉博士將光明石護在懷中，艾莉絲和天桐保護著他走出了遺跡。
此時阿克羅瑪已經操縱控製寶可夢的裝置將在白色遺跡進行工作的泥偶巨人和修繕老頭等寶可夢都控製住了。
安潔道：“搜查官我們又見麵了，還有n也是，將光明石交給我們！”
小智道：“有我在，可沒有這麽簡單！”
艾莉絲和天桐道：“還有我們呢！”
“出來吧，快龍！”
“上場了，我最優秀的岩殿居蟹！”
小智道：“那我這邊就......達克萊伊就決定是你了！”
阿克羅瑪將裝置對準了達克萊伊、快龍以及岩殿居蟹，小智道：“快點將快龍和岩殿居蟹收回去！”
阿克羅瑪的目標一開始就是達克萊伊，被光線射中後，就猩紅著雙眼看著小智。
阿克羅瑪笑道：“到此為止了！”
小智等人被等離子團的人以及寶可夢們團團圍住，等離子團用繩子將眾人都綁了起來。就在此時，魁奇思乘坐著飛行器來到了眾人的眼前。
魁奇思大笑道：“不愧是阿克羅瑪博士製造的機器，連神獸都能控製了！小智搜查官，之前你讓我的下屬給我帶的話，我現在都還給你。忘記了自我介紹了，我就是等離子團的首領魁奇思！”
n憤怒道：“魁奇思難道你又要犯兩年前的錯誤了嗎？你也看到了，召喚萊希拉姆的時候，發生了多麽可怕的事情！”
魁奇思道：“我不會重蹈覆轍的！我現在已經擁有了寶可夢控製機和光明石，你阻止不了我的！”
魁奇思大手一揮，召喚儀式開始。隨著火焰升空，整個祭台變為了火焰的鮮紅色，陣法的紋路逐漸清晰。
隻是動靜越大失望越大，小智無聊的打了哈欠道：“魁奇思，話說萊希拉姆呢？”
魁奇思難以置信道：“不可能啊！那麽就再加上這個！”魁奇思拿出了一個黑白相間的三角體，最前端有個黃色的尖刺，這就是基因之楔。魁奇思將基因之楔放在了光明石的旁邊。
小智道：“瑪夏多就是現在！”
從石台的影子中，瑪夏多現身了，它以迅雷不及掩耳之勢將基因之楔給搶了過來，等魁奇思反應過來的時候，基因之楔已經在小智的手裏了。
小智拿出了一個大師球，道：“妄想控製神獸，說出來也挺搞笑的。靠那個機器啊，再花十年的時間也是白搭。達克萊伊動手使用黑洞！對了，忘記告訴你了，達克萊伊是裝的！”
達克萊伊一個巨大的黑洞就讓被控製的寶可夢和等離子團的成員都陷入了噩夢中。隻剩了下一個魁奇思和阿克羅瑪，阿克羅瑪那邊還有火箭隊三人要去報仇呢，小智根本不用擔心，他把玩著手裏的大師球和基因之楔道：“接下來就是你的複仇時刻了！酋雷姆，就決定是你了！”
酋雷姆將基因之楔融入了體內道：“小智謝謝你！魁奇思，我的力量本源好用嗎？”
酋雷姆步步緊逼魁奇思。
小智讓達克萊伊用精神強念將眾人身上的繩子都弄斷，n道：“小智，為什麽達克萊伊沒有被控製啊！”
小智解釋道：“我的達克萊伊可是跟帕魯奇亞和帝牙盧卡對戰過的，先不說它的實力很強，這種機器控製一般的寶可夢沒問題，但是神獸的數據可是沒有，而且神獸每一隻都不簡單！想要控製它們當作兵器，是不可能成功的！計劃也來到了最後了！”
魁奇思道：“可惡！”
小智道：“結束了哦！酋雷姆，轉變形態，使用冰凍伏特！”
小智話音剛落，暗黑酋雷姆登場，當然隻有魁奇思一個人被永久冰封，這種狀態他死不了也無法擺脫冰封了。
阿克羅瑪被火箭隊的三人綁了起來，機器則是被趕來的荷蓮娜和巴貝娜給毀了。火箭隊知道這機器不能控製神獸也對此沒有了興趣，毀了就毀了。
巨大的爆炸聲響起，控製寶可夢的裝置直接被毀去。達克萊伊解除了黑洞的控製，寶可夢們都恢複了原狀。帥哥先生提前聯係的君莎小姐以及國際刑警將等離子團全部打包帶走，又一個邪惡組織在小智的手上終結！
酋雷姆重新獲得了自己的本源力量後就回到了精靈球中，當初跟隨小智也隻是單純認可了這個人類訓練家，現在是真正的認定了他就是自己的訓練家了。
等離子團的覆滅，壓在n與荷蓮娜和巴貝娜身上的枷鎖也就消失了，n邀請道：“荷蓮娜，巴貝娜，跟我一起去看看霧以外的世界吧！跟我一起去旅行，在這個現實的世界旅行！”
荷蓮娜道：“要往哪裏去呢？”
n道：“往理想的地方去！我想要找到將理想變為現實，自己能做到的事情！我需要你們的力量！”
n與荷蓮娜與巴貝娜去旅行了，為了實現人類理想的世界，小智三人目送他們離開，相信以後在某處還會再次相遇！
至於老紅豆杉博士聽說發現了新的冰之遺跡後，帶著挖掘隊的成員們馬不停蹄的離開......