在神和鎮的華麗大賽結束後第二天早上，小智幾人正準備離開了，但是走到寶可夢中心的大廳時，電視裏傳來了他們有些在意的新聞，於是停頓下來
‘現在是關於今早發生的金剛寶珠被搶奪時間的特殊報道，不幸中的萬幸，運送金剛寶珠的飛機安全著陸了，沒有造成人員傷亡，根據搭乘飛機的君莎警官所說，此次行動的作案團夥是自稱銀河隊的秘密組織’
“是銀河隊”，小剛聽到後立刻反應過來，他們之前在帷幕市有見過，當時他們也是不懷好意
‘早有傳言，銀河隊一直在神奧地區各地進行秘密活動，前不久發生在帷幕市的隕石襲擊事件，與他們有關。但是，他們的目的尚未查明。本次被偷的傳說中的金剛寶珠，是正打算從百代市的曆史博物館搬運到神和鎮的曆史研究所。曆史研究所裏保管有與金剛寶珠相對應的白玉寶珠，因為此次事件，已經加強了警戒。這次金剛寶珠的轉移是為了研究兩個寶珠會不會有什麽聯係，由於金剛寶珠被奪，預計會給神奧的曆史研究帶來很大的障礙’，電視裏繼續報導
“事情變得糟糕起來了，冠軍都回來了”，一旁的喬伊小姐憂心忡忡
“是竹蘭小姐嗎？”，小光聽後問
“是的，她到曆史研究所了，神和鎮是竹蘭小姐的家鄉，她奶奶是研究所的所長哦”
“我們去看看吧”，小智之前在帷幕市見識過銀河隊的作風，因此決定想去看看，如果他們還是不死心的作惡的，自己會繼續阻止他們的
隨後眾人感到曆史研究所，剛一到達，小光就被研究所的規模給鎮住了，而且周圍還有一些警車，而小剛那邊第一時間就發現了神奧的冠軍竹蘭小姐
“啊，華麗的冠軍。”小剛看到美麗的大姐姐舊病複發，不過突然他自己又愣了一會
“誒？沒來”，就在小剛以為自己又會被不良蛙毒擊的時候，往常的感覺居然一直沒來，小剛從花癡中恢複過來，回過頭就看到不知何時出來的不良蛙正一動不動的眺望著遠方的大樓
“竹蘭小姐”，‘皮卡丘~’，‘波加’，智光兩人也走上前打招呼
“是你們啊，好久不見了”，竹蘭看見來人也露出笑臉
“這些孩子是？”，老奶奶問道
“我之前跟你說過的，我遇到了兩個處事態度完全相反的孩子”，竹蘭小姐和老奶奶說
“哦，這就是那個小孩的反麵咯”
“小智，這是我奶奶，這座研究所的所長”
“奶奶你好，初次見麵，我是小智，這是我的搭檔皮卡丘”，‘皮卡~’
剛光兩人緊隨其後分別做了自我介紹
“我是芥子蘭，請多關照，孩子們”
“不良蛙，怎麽了嗎？”，小剛看著仍舊在那裏一動不動的不良蛙有點擔心
“也許該是感知到那座大樓頂部有什麽東西在，君莎小姐能不能麻煩你派人去查看一下，也許有銀河隊的人，他們可能正在打算搶奪白玉寶珠”，竹蘭推測到，對身邊的君沙小姐說
“好，我知道了”，君莎小姐看到相信冠軍竹蘭的判斷立馬就去安排手下做事去了
“你後來和真司怎麽樣了？”，竹蘭小姐似乎對於小智和真司的後續還是很關注的
“有遇到過，其他方麵還好，但是在小火焰猴，不…現在是猛火猴了，我們兩個的意見始終不同”，小智想起真司，直接說出了兩人不同的方向
“噢哈哈哈”，此時突然，遠處傳來莫名的笑聲，吸引了大家的注意
大家看過去，發現是一個身穿灰黑色西裝的男士，大概接近30歲的樣子，一頭藍色刺蝟頭，笑哈哈的走了過來
“啊呀，今天的客人真多啊，又來了一個不成氣候的人”，老奶奶麵對普通客人還是挺有善意的
“你應該是赤日先生吧，支撐神奧經濟的著名企業家”，竹蘭小姐認出了來人
“被冠軍這麽說實在是我的榮幸”
“神奧有很多大樓和圖書館都是這位赤日先生建造的”，竹蘭向小智他們解釋
“雖然長得不怎麽樣，但確實是神奧經濟圈的名人哦”，芥子蘭奶奶走到赤日身邊打趣道
“說我是名人，真是不好意思啊”，赤日不好意思的撓著後腦勺，明明被這麽說了，卻還是沒有什麽明顯的反感情緒，依然表現的平易近人
“我現在不過是一個在研究神奧曆史的新手”
“大概是擔心白玉寶珠才來的吧”
“是的，我看到金剛寶珠的新聞就坐不住了”
‘皮卡丘…’，“皮卡丘，你也覺得很奇怪嗎？”，皮卡丘和小智似乎都感覺到了赤日的不對勁之處，但是看竹蘭和老奶奶都很友善的樣子，小智和皮卡丘也覺得現在不方便打擾他們之間的交流
隨後大家在芥子蘭博士和竹蘭小姐的帶領下走進了研究所，芥子蘭博士開始向大家述說著自己的見解，研究所的牆上還有雕著帝牙盧卡和帕路奇亞的畫像
“這座小鎮從很久以前就跟帝牙盧卡、帕路奇亞有很深的淵源，隨著我開始調查鎮子的起源，資料就像山一樣，越堆越多，最後就我的研究所成這個樣子了”，走進研究所的書架處後，便看見上麵滿滿當當的都是資料，堆積成山
繼續向內部走去，打開一扇門後，映入眼簾的是一幅壁畫，是一個蝕刻浮雕，下方還擺著有文字的石板
浮雕是一個正三角形，中央一個如同太陽的金色標記，向三個角落輻射，三個角上各印有一隻小型寶可夢的模樣，分別呈現粉藍黃三色
“哇，好厲害的壁畫”，小光率先一步走了過去，不過看到三角的一隻寶可夢圖案便停了下來
“誒？這個是我們見過的艾姆利多嗎？”，小光看著左下角的寶可夢標記說道
“說起來我之前也見過這裏隻藍色的寶可夢”，小智和皮卡丘也發現了上麵還印有一隻自己也見過的寶可夢
“這太驚人了”，芥子蘭奶奶聽後驚呼，一旁的竹蘭和赤日也一臉驚訝
“是在哪裏？”，竹蘭小姐急切的問
“是在心齊湖”，‘波加’
“我是在立誌湖看到的”，‘皮卡’
“太不可思議了，竟然有人看到過被稱為湖之眾神的寶可夢，上麵那隻是智慧之神由克希，被認為是生活在切鋒市旁的睿智湖。這三隻據說各自隱匿在神奧的三湖中，但它們的存在僅僅是傳說罷了”，竹蘭小姐說道
“有種說法是，它們隻有靈魂從湖裏出來，守護著人們的生活，你們看到的說不定是它們的靈魂”，芥子蘭奶奶補充著三聖菇流傳下來的信息
“這中間的是什麽意思？”，小剛則看著浮雕中心猶如太陽的部分好奇的問
“根據研究，這應該是金剛寶珠或者白玉寶珠”，竹蘭解釋
“博士，給見到艾姆利多和亞克諾姆的這些人看看白玉寶珠吧，也許會有出乎意料的反應”，此時，一直在旁看戲的赤日突然提議道
“哦，這很有趣”，奶奶也是認同了這個想法
隨後眾人又被帶著進入了一處密室，在密室裏，白色寶珠被很嚴密的閉封在玻璃中，然後小智和小光在白色寶珠麵前，很長時間都沒有反應，這讓赤日突然有些激動，讓小智幾人都覺得有些莫名
就在幾人還想說些什麽，傳來了研究所被突襲的消息，幾人也無暇在這裏多待了，甚至忽略了隱藏成君沙方的火箭隊他們，直接抱著白色寶珠趕到了大廳，然後便見到了一群銀河隊打扮的人，周圍還有一群大嘴蝠
“你先抱著白玉寶珠離開，我們拖住這些人，去吧，烈咬陸鯊，海兔獸”
“我們也來，就決定是你們了，皮卡丘，猛火猴”，小智這邊也放出了兩隻寶可夢展開對戰
“上吧，帕奇利茲，波加曼”，小光這邊也派出寶可夢上場
‘姆嗚~’，而小剛的不良蛙也更早一步找到了自己的對手，是對麵一隻自己的進化型毒鬥蛙
隨後龍爪，電流、泡沫、火焰、毒刺紛紛命中對手，但是對手的數量絲毫不減，但好歹還是為後麵抱著白玉寶珠的老奶奶爭取了一段時間，準備趁這段時間離開，將其放進安全的地方，但是他們剛準備離開的時候，後麵的通道又走來了一群銀河隊，將小智他們包圍住，對手的數量也絲毫不見減少
眾人被包圍隻能顧及己身，難以讓白玉寶珠脫離，就這麽消耗下去，對竹蘭這邊很是不利，不過銀河隊那邊號線好像也很著急被小智他們遲遲拖住
就在這個時候，研究所的屋頂突然坍塌，玻璃忽然塌陷墜落，引起騷亂，同時還引起煙霧，遮掩了所有人的身形，所有人為了自保各自使出類似於光牆或者保護之類的絕招
於是在混亂之下，老奶奶手中的白色寶珠不知何時不見了，隻聽見咻的一聲，等慌亂過去之後，才看到在比大嘴蝠更高的天空上，火箭隊的熱氣球抓住了白色寶珠
“沒事吧”，等到騷亂過去之後，幾人互相問
“哈哈哈…（火箭隊台詞），你們慢慢玩吧，白玉寶珠我們火箭隊拿走了，我們要將他拿去賣了絕對會成為富翁的”，在熱氣球上的武藏叉腰很是囂張，看來之前坍塌與他們有些許關聯
“白玉寶珠居然被當做寶物買賣，你們到底知不知道它的價值，白玉寶珠，金剛寶珠，能提升神奧時空雙神的實力不在話下，但其中真正的力量必須要與三隻湖中的傳說寶可夢聚攏才能召喚出神的降臨”，赤日不知什麽時候出現在了火箭隊的熱氣球上，直接把白色寶珠從武藏手裏搶了過來，然後跳出了熱氣球，之後他的腰間出現一隻紳士鴉，載著他避免他摔落
“大叔，我不關你事誰，要從我們火箭隊這裏搶走白玉寶珠是不可能的，快還給我們”，武藏懶得聽赤日說的這一大堆狗屁，隻想快要要回寶物好賣錢
“哼！你們這些愚昧的人根本沒有資格觸碰白玉寶珠”，赤日冷哼一聲，然後正準備降落時好像想起什麽，在他的一些微動作下，那些大嘴蝠突然圍著他，眼裏不懷好意
“赤日先生，危險”，下麵的幾人有點擔心，正準備去幫忙時，一隻度臭鼬打出一道破壞光線直衝天際，大嘴蝠急忙避開，赤日也避開，然後命中了火箭隊，將他們擊飛
赤日趁這段時間準備在空隙間緊急降落，但是在他一個‘故意’失誤下，白玉寶珠被其中一隻大嘴蝠順走了，然後到了鎮星手中，降落後，赤日演技很自然的露出不甘心的表情
後來他們準備用蠻力把寶珠搶回來，但是沒想到銀河隊的直升機突然到來，他們先走一步了，一下子就撤離了大半隊員，此次神和鎮研究所這邊真是大受損失，不僅破損嚴重，還被搶走了重要的物品
事件完了之後，小智他們這邊也非常氣惱，這次己方這邊真是太被動了
‘皮卡~’，皮卡丘這邊安慰著小智
“非常抱歉，沒有幫上忙，我要先走了，各位，再見了”，赤日這個時候，站起身，和大家告別了，臉上還維持著之前一臉不甘心的表情，真是一個好演員啊
“竹蘭小姐，怎麽了嗎？”，小光看著竹蘭一直盯著赤日離開的方向，不解的問
“沒什麽”，竹蘭回過神來
“對了，小智，你接下來的目標是哪個道館？”
“緣之市的道館，已經和梅麗莎小姐約定好了”
“加油，我會支持你的”
“謝謝”
“我這邊也要暫時回歸日常生活了，不久後，將會有賭上冠軍之位的冠軍衛冕戰”，幾人用別的話題分散了一些保護不利的壞心情後，便各自分開了
‘現在是關於今早發生的金剛寶珠被搶奪時間的特殊報道，不幸中的萬幸，運送金剛寶珠的飛機安全著陸了，沒有造成人員傷亡，根據搭乘飛機的君莎警官所說，此次行動的作案團夥是自稱銀河隊的秘密組織’
“是銀河隊”，小剛聽到後立刻反應過來，他們之前在帷幕市有見過，當時他們也是不懷好意
‘早有傳言，銀河隊一直在神奧地區各地進行秘密活動，前不久發生在帷幕市的隕石襲擊事件，與他們有關。但是，他們的目的尚未查明。本次被偷的傳說中的金剛寶珠，是正打算從百代市的曆史博物館搬運到神和鎮的曆史研究所。曆史研究所裏保管有與金剛寶珠相對應的白玉寶珠，因為此次事件，已經加強了警戒。這次金剛寶珠的轉移是為了研究兩個寶珠會不會有什麽聯係，由於金剛寶珠被奪，預計會給神奧的曆史研究帶來很大的障礙’，電視裏繼續報導
“事情變得糟糕起來了，冠軍都回來了”，一旁的喬伊小姐憂心忡忡
“是竹蘭小姐嗎？”，小光聽後問
“是的，她到曆史研究所了，神和鎮是竹蘭小姐的家鄉，她奶奶是研究所的所長哦”
“我們去看看吧”，小智之前在帷幕市見識過銀河隊的作風，因此決定想去看看，如果他們還是不死心的作惡的，自己會繼續阻止他們的
隨後眾人感到曆史研究所，剛一到達，小光就被研究所的規模給鎮住了，而且周圍還有一些警車，而小剛那邊第一時間就發現了神奧的冠軍竹蘭小姐
“啊，華麗的冠軍。”小剛看到美麗的大姐姐舊病複發，不過突然他自己又愣了一會
“誒？沒來”，就在小剛以為自己又會被不良蛙毒擊的時候，往常的感覺居然一直沒來，小剛從花癡中恢複過來，回過頭就看到不知何時出來的不良蛙正一動不動的眺望著遠方的大樓
“竹蘭小姐”，‘皮卡丘~’，‘波加’，智光兩人也走上前打招呼
“是你們啊，好久不見了”，竹蘭看見來人也露出笑臉
“這些孩子是？”，老奶奶問道
“我之前跟你說過的，我遇到了兩個處事態度完全相反的孩子”，竹蘭小姐和老奶奶說
“哦，這就是那個小孩的反麵咯”
“小智，這是我奶奶，這座研究所的所長”
“奶奶你好，初次見麵，我是小智，這是我的搭檔皮卡丘”，‘皮卡~’
剛光兩人緊隨其後分別做了自我介紹
“我是芥子蘭，請多關照，孩子們”
“不良蛙，怎麽了嗎？”，小剛看著仍舊在那裏一動不動的不良蛙有點擔心
“也許該是感知到那座大樓頂部有什麽東西在，君莎小姐能不能麻煩你派人去查看一下，也許有銀河隊的人，他們可能正在打算搶奪白玉寶珠”，竹蘭推測到，對身邊的君沙小姐說
“好，我知道了”，君莎小姐看到相信冠軍竹蘭的判斷立馬就去安排手下做事去了
“你後來和真司怎麽樣了？”，竹蘭小姐似乎對於小智和真司的後續還是很關注的
“有遇到過，其他方麵還好，但是在小火焰猴，不…現在是猛火猴了，我們兩個的意見始終不同”，小智想起真司，直接說出了兩人不同的方向
“噢哈哈哈”，此時突然，遠處傳來莫名的笑聲，吸引了大家的注意
大家看過去，發現是一個身穿灰黑色西裝的男士，大概接近30歲的樣子，一頭藍色刺蝟頭，笑哈哈的走了過來
“啊呀，今天的客人真多啊，又來了一個不成氣候的人”，老奶奶麵對普通客人還是挺有善意的
“你應該是赤日先生吧，支撐神奧經濟的著名企業家”，竹蘭小姐認出了來人
“被冠軍這麽說實在是我的榮幸”
“神奧有很多大樓和圖書館都是這位赤日先生建造的”，竹蘭向小智他們解釋
“雖然長得不怎麽樣，但確實是神奧經濟圈的名人哦”，芥子蘭奶奶走到赤日身邊打趣道
“說我是名人，真是不好意思啊”，赤日不好意思的撓著後腦勺，明明被這麽說了，卻還是沒有什麽明顯的反感情緒，依然表現的平易近人
“我現在不過是一個在研究神奧曆史的新手”
“大概是擔心白玉寶珠才來的吧”
“是的，我看到金剛寶珠的新聞就坐不住了”
‘皮卡丘…’，“皮卡丘，你也覺得很奇怪嗎？”，皮卡丘和小智似乎都感覺到了赤日的不對勁之處，但是看竹蘭和老奶奶都很友善的樣子，小智和皮卡丘也覺得現在不方便打擾他們之間的交流
隨後大家在芥子蘭博士和竹蘭小姐的帶領下走進了研究所，芥子蘭博士開始向大家述說著自己的見解，研究所的牆上還有雕著帝牙盧卡和帕路奇亞的畫像
“這座小鎮從很久以前就跟帝牙盧卡、帕路奇亞有很深的淵源，隨著我開始調查鎮子的起源，資料就像山一樣，越堆越多，最後就我的研究所成這個樣子了”，走進研究所的書架處後，便看見上麵滿滿當當的都是資料，堆積成山
繼續向內部走去，打開一扇門後，映入眼簾的是一幅壁畫，是一個蝕刻浮雕，下方還擺著有文字的石板
浮雕是一個正三角形，中央一個如同太陽的金色標記，向三個角落輻射，三個角上各印有一隻小型寶可夢的模樣，分別呈現粉藍黃三色
“哇，好厲害的壁畫”，小光率先一步走了過去，不過看到三角的一隻寶可夢圖案便停了下來
“誒？這個是我們見過的艾姆利多嗎？”，小光看著左下角的寶可夢標記說道
“說起來我之前也見過這裏隻藍色的寶可夢”，小智和皮卡丘也發現了上麵還印有一隻自己也見過的寶可夢
“這太驚人了”，芥子蘭奶奶聽後驚呼，一旁的竹蘭和赤日也一臉驚訝
“是在哪裏？”，竹蘭小姐急切的問
“是在心齊湖”，‘波加’
“我是在立誌湖看到的”，‘皮卡’
“太不可思議了，竟然有人看到過被稱為湖之眾神的寶可夢，上麵那隻是智慧之神由克希，被認為是生活在切鋒市旁的睿智湖。這三隻據說各自隱匿在神奧的三湖中，但它們的存在僅僅是傳說罷了”，竹蘭小姐說道
“有種說法是，它們隻有靈魂從湖裏出來，守護著人們的生活，你們看到的說不定是它們的靈魂”，芥子蘭奶奶補充著三聖菇流傳下來的信息
“這中間的是什麽意思？”，小剛則看著浮雕中心猶如太陽的部分好奇的問
“根據研究，這應該是金剛寶珠或者白玉寶珠”，竹蘭解釋
“博士，給見到艾姆利多和亞克諾姆的這些人看看白玉寶珠吧，也許會有出乎意料的反應”，此時，一直在旁看戲的赤日突然提議道
“哦，這很有趣”，奶奶也是認同了這個想法
隨後眾人又被帶著進入了一處密室，在密室裏，白色寶珠被很嚴密的閉封在玻璃中，然後小智和小光在白色寶珠麵前，很長時間都沒有反應，這讓赤日突然有些激動，讓小智幾人都覺得有些莫名
就在幾人還想說些什麽，傳來了研究所被突襲的消息，幾人也無暇在這裏多待了，甚至忽略了隱藏成君沙方的火箭隊他們，直接抱著白色寶珠趕到了大廳，然後便見到了一群銀河隊打扮的人，周圍還有一群大嘴蝠
“你先抱著白玉寶珠離開，我們拖住這些人，去吧，烈咬陸鯊，海兔獸”
“我們也來，就決定是你們了，皮卡丘，猛火猴”，小智這邊也放出了兩隻寶可夢展開對戰
“上吧，帕奇利茲，波加曼”，小光這邊也派出寶可夢上場
‘姆嗚~’，而小剛的不良蛙也更早一步找到了自己的對手，是對麵一隻自己的進化型毒鬥蛙
隨後龍爪，電流、泡沫、火焰、毒刺紛紛命中對手，但是對手的數量絲毫不減，但好歹還是為後麵抱著白玉寶珠的老奶奶爭取了一段時間，準備趁這段時間離開，將其放進安全的地方，但是他們剛準備離開的時候，後麵的通道又走來了一群銀河隊，將小智他們包圍住，對手的數量也絲毫不見減少
眾人被包圍隻能顧及己身，難以讓白玉寶珠脫離，就這麽消耗下去，對竹蘭這邊很是不利，不過銀河隊那邊號線好像也很著急被小智他們遲遲拖住
就在這個時候，研究所的屋頂突然坍塌，玻璃忽然塌陷墜落，引起騷亂，同時還引起煙霧，遮掩了所有人的身形，所有人為了自保各自使出類似於光牆或者保護之類的絕招
於是在混亂之下，老奶奶手中的白色寶珠不知何時不見了，隻聽見咻的一聲，等慌亂過去之後，才看到在比大嘴蝠更高的天空上，火箭隊的熱氣球抓住了白色寶珠
“沒事吧”，等到騷亂過去之後，幾人互相問
“哈哈哈…（火箭隊台詞），你們慢慢玩吧，白玉寶珠我們火箭隊拿走了，我們要將他拿去賣了絕對會成為富翁的”，在熱氣球上的武藏叉腰很是囂張，看來之前坍塌與他們有些許關聯
“白玉寶珠居然被當做寶物買賣，你們到底知不知道它的價值，白玉寶珠，金剛寶珠，能提升神奧時空雙神的實力不在話下，但其中真正的力量必須要與三隻湖中的傳說寶可夢聚攏才能召喚出神的降臨”，赤日不知什麽時候出現在了火箭隊的熱氣球上，直接把白色寶珠從武藏手裏搶了過來，然後跳出了熱氣球，之後他的腰間出現一隻紳士鴉，載著他避免他摔落
“大叔，我不關你事誰，要從我們火箭隊這裏搶走白玉寶珠是不可能的，快還給我們”，武藏懶得聽赤日說的這一大堆狗屁，隻想快要要回寶物好賣錢
“哼！你們這些愚昧的人根本沒有資格觸碰白玉寶珠”，赤日冷哼一聲，然後正準備降落時好像想起什麽，在他的一些微動作下，那些大嘴蝠突然圍著他，眼裏不懷好意
“赤日先生，危險”，下麵的幾人有點擔心，正準備去幫忙時，一隻度臭鼬打出一道破壞光線直衝天際，大嘴蝠急忙避開，赤日也避開，然後命中了火箭隊，將他們擊飛
赤日趁這段時間準備在空隙間緊急降落，但是在他一個‘故意’失誤下，白玉寶珠被其中一隻大嘴蝠順走了，然後到了鎮星手中，降落後，赤日演技很自然的露出不甘心的表情
後來他們準備用蠻力把寶珠搶回來，但是沒想到銀河隊的直升機突然到來，他們先走一步了，一下子就撤離了大半隊員，此次神和鎮研究所這邊真是大受損失，不僅破損嚴重，還被搶走了重要的物品
事件完了之後，小智他們這邊也非常氣惱，這次己方這邊真是太被動了
‘皮卡~’，皮卡丘這邊安慰著小智
“非常抱歉，沒有幫上忙，我要先走了，各位，再見了”，赤日這個時候，站起身，和大家告別了，臉上還維持著之前一臉不甘心的表情，真是一個好演員啊
“竹蘭小姐，怎麽了嗎？”，小光看著竹蘭一直盯著赤日離開的方向，不解的問
“沒什麽”，竹蘭回過神來
“對了，小智，你接下來的目標是哪個道館？”
“緣之市的道館，已經和梅麗莎小姐約定好了”
“加油，我會支持你的”
“謝謝”
“我這邊也要暫時回歸日常生活了，不久後，將會有賭上冠軍之位的冠軍衛冕戰”，幾人用別的話題分散了一些保護不利的壞心情後，便各自分開了