在羅氏家眾將的勇猛表現下，曆經一個多月，甲斐親直的大軍一路行進，一路將沿路的阻擋勢力連根拔起。
天文十六年（一五四七），九月，正是秋收之際，甲斐親直的大軍也殺到了葦北郡最後一座重鎮水俁城下。
在甲斐親直大軍到來之前，為了加強水俁城的防守，守城大將犬童賴安幾乎將周邊所有的勢力都召集到了水俁城中。此時的水俁城集中了近一千人的守城大軍，而甲斐親直的大軍則是有四千餘人。
而趁著犬童賴安將薩肥邊境的守兵都調往了水俁城中之時，此前一直在水俁城附近負責牽製犬童賴安的守城大軍的阿蘇惟前則是乘機奪取了把控著從葦北郡進出薩摩出水郡的小城砦中尾城。
掌控了這座城砦，不但可以提前預警對麵出水郡島津家的入侵，更加與甲斐親直的大軍形成對水俁城的前後夾擊之勢。
兩軍對壘，立即就展開了激烈的籠城戰。在連續數日攻城未果後，甲斐親直果斷改變了攻城策略，他暫停了攻城戰，改為派人將水俁城附近所有的勢力先行拔除掉，同時將城中的守兵的家人驅趕到水俁城下，每日在城下高聲勸降城中的親人。
期間雙方又經曆了數場激烈的籠城戰，但是依然未能分出高下，城中的人未能擊退城外的人，城外的人也未能攻克水俁城。
激戰持續了數月，眼看就要進入年底。甲斐親直按照與政良的約定，暗中通過已經徹底控製了八代海羅氏家水軍運來了大量羅氏家的專有攻城兵器。準備一舉拿下水俁城。
此前之所以沒有立即使用這些攻城兵器。一是城中守兵士氣正旺。即便使用這些兵器強行攻城，估計傷亡也會很慘重。
二是，政良希望通過這場戰爭鍛煉一下新組建的第七常備足輕番隊。雖然這個番隊同樣是采用以老帶新的辦法，從其他各個番隊裏抽取一部分的老兵進入新番隊擔任組頭，以此來促使新兵迅速成長起來，但番隊中的新兵畢竟還是占據了大部分的，正好利用這一次南肥後之戰鍛煉一番。
三是，甲斐親直有意利用攻城戰將當地投誠的豪族地頭的勢力削弱一番。這也是得到了政良的首肯的。隻是現在眼看就要進入冬季了。天氣逐漸轉冷，是很不利於作戰的，所以無論甲斐親直還是政良都希望盡快結束戰事了。
而此時的城內守兵，實際上也是士氣大降了。主要是因為眼看了就要進入冬季，要是對方還賴在城外不退軍的話，他們明年的春耕就要泡湯了。要知道，因為戰爭的關係，他們已經錯過了今年的秋收了，要是再錯過明年的春耕，到時候就算城外的大軍退走。他們也要準備在明年吃西北風去了。
就在甲斐親直磨刀霍霍準備發動對水俁城的總攻之時，一個神秘人卻拿著政良的親筆命令進入了甲斐親直的軍營中。稍作停留後。他又前往了水俁城下，得到了進入水俁城的機會。
兩日後，水俁城城門打開，堅守了數月的水俁城，終於在守城大將犬童賴安的決定下，獻城投降。這可謂是皆大歡喜的結局了。
而此次負責勸降的這個神秘人，正是原相良家的家臣上村長重。此前他的兄長上村賴興企圖毒殺他，正是被暗中保護他的羅氏家忍者所救的。在得知相良義滋死在鷹峰城後，他就成為了羅氏家的家臣了。在前來水俁城之前，他一直在八代郡、球磨郡羅氏家的占領區域內協助羅氏家內政閣接收領地。
當他得知水俁城的情況後，立即就向政良提出了前往勸降的請求。畢竟水俁城中的犬童賴安也算得上是他的至交了，他不可能眼睜睜地看著犬童賴安被殺的。於是才有了犬童賴安後來獻城投降。
隨著水俁城的陷落，整個南肥後就隻剩下東球磨郡這一塊地方沒被攻克了。隻是，此時東球磨郡已經結成了一個對抗甲斐親直大軍的聯盟，甚至還拉攏了南薩摩的北原家以及日向的伊東家作為靠山，再加上軍勢連續作戰大半年後，已經逐顯疲倦了，天氣又開始變冷，不利於大軍作戰，最終政良隻得暫時放棄了繼續攻略東球磨郡的打算，準備留待下一年再作了斷。
趁著這段停戰時間，政良再次對有關番隊的駐地進行了變更。
甲斐親直、高阪昌信、吉川興經、上村本綱所統領的第七常備足輕番隊，駐地為南肥後，具體分工為，甲斐親直、吉川興經帶領二百個常備駐守八代郡的高塚城；高阪昌信帶領二百個常備駐守葦北郡的水俁城，同時分兵把守與薩摩出水郡出水城接壤的中尾城以及與出水郡大口城接壤的鬼山城；上村本綱帶領一百個常備以及一部分臨時征募的農兵負責把守人吉城。
水軍第三常備番隊，總駐地改為南肥後八代郡球磨川出海口附近的八代城，除此地之外，番隊將分出數個小隊，分別駐紮在宇南肥前高原郡的深江城、天草郡的棲本城以及誌岐城、久玉城，主要守護區域是有明海、島原灣、橘灣、天草灘以及八代海，防備來自海上的威脅，尤其是島原灣對麵肥後各豪族以及八代海、薩摩海域的海上威脅，同時負責向途徑本家所在海域的商船收取一定的過路費，並保證這些船隻的安全。
此外，這一次在八代城下的一戰，也繳獲了不少的相良家水軍船隻，因此，政良對水軍也進行了擴軍。
水軍第一番隊人數由五百常備增加到六百常備，船隻方麵，小早一百六十艘，關船五十艘。主將為孫五郎、村上隆重，副將為大矢野種光、上津浦種教，駐地為唐津灣原波多家水軍的海港，負責從唐津灣至呼子灣加部島沿岸隻見的海域的防備，主要是防備沿海的一些海賊以及來自壹岐以及築前的海上勢力的威脅。同時還負責向途徑本家所在海域的商船收取一定的過路費，並保證這些船隻的安全。
水軍第二常備番隊人數同樣由五百常備增加到六百常備，小早一百九十艘，關船六十五艘，主將為忽那通著，副將為福田兼次、上津浦重貞，駐地分別為肥前鬆浦郡的平戶港、五島的城山城、五島的江川城、彼杵郡的福田城，主要守護區域是平戶島海域、五島海域、長崎半島沿海，防備來自海上的威脅，尤其是薩摩方向的水軍威脅，必要時，及時支援兩側的第一、第三常備水軍番隊，同時負責向途徑本家所在海域的商船收取一定的過路費，並保證這些船隻的安全。
至於最後的水軍第三常備番隊，常備為六百人保持不變，小早一百八十艘，關船七十艘。主將為田尾政虎、村上武吉，副將為大矢野種鄉、宇久純定。
投降的將領方麵，也得到了安置。
其中，在上村長重勸說下，深水瀨謙、深水瀨方兩人也最終決定投靠羅氏家。深水瀨謙成為的羅氏家的奉行，被派往肥前國協助東鄉平次管理肥前民事、農事。深水瀨方同樣也是成為了羅氏家的奉行，被派往築後國協助有馬晴純管理築後民事、農事。
甚至深水瀨謙剛剛遠元服的兒子，日後成為相良家支柱的深水長智，也被政良提前起用，成為了羅氏家的奉行，留在肥後國協助鍋島清房管理肥後民事、農事。
協助羅氏家攻略球磨郡，並且出兵解救被軟禁在人吉城中的相良家眾家臣家眷，從而令上村賴興措手不及的相良治賴，也成為了羅氏家的奉行，留在肥後國協助鍋島清房管理肥後民事、農事。
同時，為了獎賞他此前對羅氏家的貢獻，政良不但保留了他原來的領地，甚至還在築後國另外分封了一塊領地給他。
跟相良治賴相類似的上村長重，也同樣成為了羅氏家的奉行，被派往築後國協助有馬晴純管理築後民事、農事。由於他原來的領地是在上村城附近的，現在仍然還是被上村家占據著，所以政良同樣在築後分封了一塊兩倍於他原來家族領地收入的領地給他。這讓他當場感激不已。
行軍將領方麵。
在八代郡通過甲斐親直的勸降而投誠羅氏家的赤池長任與丸目賴美。前者稱為羅氏家足輕大將，被委派到木下昌直所統領的第四常備足輕番隊擔任副將。後者則同樣也成為了羅氏家的足輕大將，被委派到圓城寺信胤所統領的第六常備足輕番隊擔任副將。
在高尾城投誠的佐牟田長堅則是作為足輕大將，被委派到大石智久所統領的第二常備足輕番隊擔任副將。
而犬童賴安則是作為足輕大將，被委派到吉田重政所統領的第三常備足輕番隊擔任副將。
所有事情安頓後以後，政良立即讓眾人各安其職，迅速將新占據的領地掌控下來。尤其是內政閣，必須爭取在短時間內將新占據領地的石高以及人口情況普查出來。(未完待續請搜索，小說更好更新更快!
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天文十六年（一五四七），九月，正是秋收之際，甲斐親直的大軍也殺到了葦北郡最後一座重鎮水俁城下。
在甲斐親直大軍到來之前，為了加強水俁城的防守，守城大將犬童賴安幾乎將周邊所有的勢力都召集到了水俁城中。此時的水俁城集中了近一千人的守城大軍，而甲斐親直的大軍則是有四千餘人。
而趁著犬童賴安將薩肥邊境的守兵都調往了水俁城中之時，此前一直在水俁城附近負責牽製犬童賴安的守城大軍的阿蘇惟前則是乘機奪取了把控著從葦北郡進出薩摩出水郡的小城砦中尾城。
掌控了這座城砦，不但可以提前預警對麵出水郡島津家的入侵，更加與甲斐親直的大軍形成對水俁城的前後夾擊之勢。
兩軍對壘，立即就展開了激烈的籠城戰。在連續數日攻城未果後，甲斐親直果斷改變了攻城策略，他暫停了攻城戰，改為派人將水俁城附近所有的勢力先行拔除掉，同時將城中的守兵的家人驅趕到水俁城下，每日在城下高聲勸降城中的親人。
期間雙方又經曆了數場激烈的籠城戰，但是依然未能分出高下，城中的人未能擊退城外的人，城外的人也未能攻克水俁城。
激戰持續了數月，眼看就要進入年底。甲斐親直按照與政良的約定，暗中通過已經徹底控製了八代海羅氏家水軍運來了大量羅氏家的專有攻城兵器。準備一舉拿下水俁城。
此前之所以沒有立即使用這些攻城兵器。一是城中守兵士氣正旺。即便使用這些兵器強行攻城，估計傷亡也會很慘重。
二是，政良希望通過這場戰爭鍛煉一下新組建的第七常備足輕番隊。雖然這個番隊同樣是采用以老帶新的辦法，從其他各個番隊裏抽取一部分的老兵進入新番隊擔任組頭，以此來促使新兵迅速成長起來，但番隊中的新兵畢竟還是占據了大部分的，正好利用這一次南肥後之戰鍛煉一番。
三是，甲斐親直有意利用攻城戰將當地投誠的豪族地頭的勢力削弱一番。這也是得到了政良的首肯的。隻是現在眼看就要進入冬季了。天氣逐漸轉冷，是很不利於作戰的，所以無論甲斐親直還是政良都希望盡快結束戰事了。
而此時的城內守兵，實際上也是士氣大降了。主要是因為眼看了就要進入冬季，要是對方還賴在城外不退軍的話，他們明年的春耕就要泡湯了。要知道，因為戰爭的關係，他們已經錯過了今年的秋收了，要是再錯過明年的春耕，到時候就算城外的大軍退走。他們也要準備在明年吃西北風去了。
就在甲斐親直磨刀霍霍準備發動對水俁城的總攻之時，一個神秘人卻拿著政良的親筆命令進入了甲斐親直的軍營中。稍作停留後。他又前往了水俁城下，得到了進入水俁城的機會。
兩日後，水俁城城門打開，堅守了數月的水俁城，終於在守城大將犬童賴安的決定下，獻城投降。這可謂是皆大歡喜的結局了。
而此次負責勸降的這個神秘人，正是原相良家的家臣上村長重。此前他的兄長上村賴興企圖毒殺他，正是被暗中保護他的羅氏家忍者所救的。在得知相良義滋死在鷹峰城後，他就成為了羅氏家的家臣了。在前來水俁城之前，他一直在八代郡、球磨郡羅氏家的占領區域內協助羅氏家內政閣接收領地。
當他得知水俁城的情況後，立即就向政良提出了前往勸降的請求。畢竟水俁城中的犬童賴安也算得上是他的至交了，他不可能眼睜睜地看著犬童賴安被殺的。於是才有了犬童賴安後來獻城投降。
隨著水俁城的陷落，整個南肥後就隻剩下東球磨郡這一塊地方沒被攻克了。隻是，此時東球磨郡已經結成了一個對抗甲斐親直大軍的聯盟，甚至還拉攏了南薩摩的北原家以及日向的伊東家作為靠山，再加上軍勢連續作戰大半年後，已經逐顯疲倦了，天氣又開始變冷，不利於大軍作戰，最終政良隻得暫時放棄了繼續攻略東球磨郡的打算，準備留待下一年再作了斷。
趁著這段停戰時間，政良再次對有關番隊的駐地進行了變更。
甲斐親直、高阪昌信、吉川興經、上村本綱所統領的第七常備足輕番隊，駐地為南肥後，具體分工為，甲斐親直、吉川興經帶領二百個常備駐守八代郡的高塚城；高阪昌信帶領二百個常備駐守葦北郡的水俁城，同時分兵把守與薩摩出水郡出水城接壤的中尾城以及與出水郡大口城接壤的鬼山城；上村本綱帶領一百個常備以及一部分臨時征募的農兵負責把守人吉城。
水軍第三常備番隊，總駐地改為南肥後八代郡球磨川出海口附近的八代城，除此地之外，番隊將分出數個小隊，分別駐紮在宇南肥前高原郡的深江城、天草郡的棲本城以及誌岐城、久玉城，主要守護區域是有明海、島原灣、橘灣、天草灘以及八代海，防備來自海上的威脅，尤其是島原灣對麵肥後各豪族以及八代海、薩摩海域的海上威脅，同時負責向途徑本家所在海域的商船收取一定的過路費，並保證這些船隻的安全。
此外，這一次在八代城下的一戰，也繳獲了不少的相良家水軍船隻，因此，政良對水軍也進行了擴軍。
水軍第一番隊人數由五百常備增加到六百常備，船隻方麵，小早一百六十艘，關船五十艘。主將為孫五郎、村上隆重，副將為大矢野種光、上津浦種教，駐地為唐津灣原波多家水軍的海港，負責從唐津灣至呼子灣加部島沿岸隻見的海域的防備，主要是防備沿海的一些海賊以及來自壹岐以及築前的海上勢力的威脅。同時還負責向途徑本家所在海域的商船收取一定的過路費，並保證這些船隻的安全。
水軍第二常備番隊人數同樣由五百常備增加到六百常備，小早一百九十艘，關船六十五艘，主將為忽那通著，副將為福田兼次、上津浦重貞，駐地分別為肥前鬆浦郡的平戶港、五島的城山城、五島的江川城、彼杵郡的福田城，主要守護區域是平戶島海域、五島海域、長崎半島沿海，防備來自海上的威脅，尤其是薩摩方向的水軍威脅，必要時，及時支援兩側的第一、第三常備水軍番隊，同時負責向途徑本家所在海域的商船收取一定的過路費，並保證這些船隻的安全。
至於最後的水軍第三常備番隊，常備為六百人保持不變，小早一百八十艘，關船七十艘。主將為田尾政虎、村上武吉，副將為大矢野種鄉、宇久純定。
投降的將領方麵，也得到了安置。
其中，在上村長重勸說下，深水瀨謙、深水瀨方兩人也最終決定投靠羅氏家。深水瀨謙成為的羅氏家的奉行，被派往肥前國協助東鄉平次管理肥前民事、農事。深水瀨方同樣也是成為了羅氏家的奉行，被派往築後國協助有馬晴純管理築後民事、農事。
甚至深水瀨謙剛剛遠元服的兒子，日後成為相良家支柱的深水長智，也被政良提前起用，成為了羅氏家的奉行，留在肥後國協助鍋島清房管理肥後民事、農事。
協助羅氏家攻略球磨郡，並且出兵解救被軟禁在人吉城中的相良家眾家臣家眷，從而令上村賴興措手不及的相良治賴，也成為了羅氏家的奉行，留在肥後國協助鍋島清房管理肥後民事、農事。
同時，為了獎賞他此前對羅氏家的貢獻，政良不但保留了他原來的領地，甚至還在築後國另外分封了一塊領地給他。
跟相良治賴相類似的上村長重，也同樣成為了羅氏家的奉行，被派往築後國協助有馬晴純管理築後民事、農事。由於他原來的領地是在上村城附近的，現在仍然還是被上村家占據著，所以政良同樣在築後分封了一塊兩倍於他原來家族領地收入的領地給他。這讓他當場感激不已。
行軍將領方麵。
在八代郡通過甲斐親直的勸降而投誠羅氏家的赤池長任與丸目賴美。前者稱為羅氏家足輕大將，被委派到木下昌直所統領的第四常備足輕番隊擔任副將。後者則同樣也成為了羅氏家的足輕大將，被委派到圓城寺信胤所統領的第六常備足輕番隊擔任副將。
在高尾城投誠的佐牟田長堅則是作為足輕大將，被委派到大石智久所統領的第二常備足輕番隊擔任副將。
而犬童賴安則是作為足輕大將，被委派到吉田重政所統領的第三常備足輕番隊擔任副將。
所有事情安頓後以後，政良立即讓眾人各安其職，迅速將新占據的領地掌控下來。尤其是內政閣，必須爭取在短時間內將新占據領地的石高以及人口情況普查出來。(未完待續請搜索，小說更好更新更快!
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