玄齡與杜杲之兄孫如晦皆預選，吏部侍郎高孝基名知人，見玄齡，歎曰：“仆閱人多矣，未見如此郎者，異日必為偉器，恨不見其大成耳！”見如晦，謂曰：“君有應變之才，必任棟梁之重。”俱以子孫托之。
帝晚年深信佛道鬼神，辛巳，始詔“有盜毀佛及天尊、嶽、鎮、海、瀆神像者，以不道論；沙門毀佛像，道士毀天尊像者，以惡逆論。”
是歲，征同州刺史蔡王智積入朝。智積，帝之弟子也。性修謹，門無私謁，自奉簡素，帝甚憐之。智積有五男，止敎讀論語，不令交通賓客。或問其故，智積曰：“卿非知我者！”其意蓋恐諸子有才能以致禍也。
齊州行參軍章武王伽送流囚李參等七十餘人詣京師，行至滎陽，哀其辛苦，悉呼謂曰：“卿輩自犯國刑，身嬰縲絏，固其職也；重勞援卒，豈不愧心哉！”參等辭謝。伽乃悉脫其枷鎖，停援卒，與約曰：“某日當至京師，如致前卻，吾當為汝受死。”遂舍之而去。流人感悅，如期而至，一無離叛。上聞而驚異，召見與語，稱善久之。於是悉召流人，令攜負妻子俱入，賜宴於殿庭而赦之。因下詔曰：“凡在有生，含靈稟性，鹹知善惡，並識是非。若臨以至誠，明加勸導，則俗必從化，人皆遷善。往以海內亂離，德敎廢絕，吏無慈愛之心，民懷奸詐之意。朕思遵聖法，以德化民，而伽深識朕意，誠心倡導，參等感悟，自赴憲司：明是率土之人，非為難敎。若使官盡王伽之儔，民皆李參之輩，刑厝不用，其何遠哉！”乃擢伽為雍令。
太史令袁充表稱：“隋興已後，晝日漸長，開皇元年，冬至之景長一丈二尺七寸二分；自爾漸短，至十七年，短於舊三寸七分。日去極近則景短而日長，去極遠則景長而日短；行內道則去極近，行外道則去極遠。謹按元命包曰："日月出內道，璿璣得其常。"京房別對曰："太平，日行上道；升平，行次道；霸代，行下道。"伏惟大隋啟運，上感幹元，景短日長，振古希有。”上臨朝，謂百官曰：“景長之慶，天之佑也。今太子新立，當須改元，宜取日長之意以為年號。”是後百工作役，並加程課，以日長故也。丁匠苦之。
文帝仁壽元年（辛酉，公元六〇一年）
春，正月，乙酉朔，赦天下，改元。
以尚書右仆射楊素為左仆射，納言蘇威為右仆射。
丁酉，徙河南王昭為晉王。
突厥步迦可汗犯塞，敗代州總管韓弘於恒安。
以晉王昭為內史令。
二月，乙卯朔，日有食之。
夏，五月，己醜，突厥男女九萬口來降。
六月，乙卯，遣十六使巡省風俗。
乙醜，詔以天下學校生徒多而不精，唯簡留國子學生七十人，太學、四門及州縣學並廢。殿內將軍河間劉炫上表切諫，不聽。秋，七月，改國子學為太學。
初，帝受周禪，恐民心未服，故多稱符瑞以耀之，其偽造而獻者，不可勝計。冬，十一月，己醜，有事於南郊，如封禪禮，版文備述前後符瑞以報謝雲。
山獠作亂，以衛尉少卿洛陽衛文升為資州刺史鎮撫之。文升名玄，以字行。初到官，獠方攻大牢鎮，文升單騎造其營，謂曰：“我是刺史，銜天子詔，贍養汝等，勿驚懼也！”羣獠莫敢動。於是說以利害，渠帥感悅，解兵而去，前後歸附者十餘萬口。帝大悅，賜縑二千匹。壬辰，以文升為遂州總管。
潮、成等五州獠反，高州酋長馮盎馳詣京師，請討之。帝敕楊素與盎論賊形勢，素歎曰：“不意蠻夷中有如是人！”卽遣盎發江、嶺兵擊之。事平，除盎漢陽太守。
詔以楊素為雲州道行軍元帥，長孫晟為受降使者，挾啟民可汗北擊步迦。
文帝仁壽二年（壬戌，公元六〇二年）
春，三月，己亥，上幸仁壽宮。
突厥思力俟斤等南渡河，掠啟民男女六千口、雜畜二十餘萬而去。楊素帥諸軍追擊，轉戰六十餘裏，大破之，突厥北走。素複進追，夜，及之，恐其越逸，令其騎稍後，親引兩騎並降突厥二人與虜並行，虜不之覺；候其頓舍未定，趣後騎掩擊，大破之，悉得人畜以歸啟民。自是突厥遠遁，磧南無複寇抄。素以功進子玄感柱國，賜玄縱爵淮南公。
兵部尚書柳述，慶之孫也，尚蘭陵公主，怙寵使氣，自楊素之屬皆下之。帝問符璽直長萬年韋雲起：“外間有不便事，可言之。”述時侍側，雲起奏曰：“柳述驕豪，未嚐經事，兵機要重，非其所堪，徒以主壻，遂居要職。臣恐物議以陛下為"官不擇賢，專私所愛"，斯亦不便之大者。”帝甚然其言，顧謂述曰：“雲起之言，汝藥石也，可師友之。”秋，七月，丙戌，詔內外官各舉所知。柳述舉雲起，除通事舍人。
益州總管蜀王秀，容貌瓌偉，有膽氣，好武藝。帝每謂獨孤後曰：“秀必以惡終，我在當無慮，至兄弟，必反矣。”大將軍劉噲之討西爨也，帝令上開府儀同三司楊武通將兵繼進。秀以嬖人萬智光為武通行軍司馬。帝以秀任非其人，譴責之，因謂羣臣曰：“壞我法者，子孫也。譬如猛虎，物不能害，反為毛間蟲所損食耳。”遂分秀所統。
自長史元岩卒後，秀漸奢僭，造渾天儀，多捕山獠充宦者，車馬被服，擬於乘輿。
及太子勇以讒廢，晉王廣為太子，秀意甚不平。太子恐秀終為後患，陰令楊素求其罪而譖之。上遂征秀，秀猶豫，欲謝病不行。總管司馬源師諫，秀作色曰：“此自我家事，何預卿也！”師垂涕對曰：“師忝參府幕，敢不盡忠！聖上有敕追王，以淹時月，今乃遷延未去。百姓不識王心，儻生異議，內外疑駭，發雷霆之詔，降一介之使，王何以自明？願王熟計之！”朝廷恐秀生變，戊子，以原州總管獨孤楷為益州總管，馳傳代之。楷至，秀猶未肯行；楷諷諭久之，乃就路。楷察秀有悔色，因勒兵為備；秀行四十餘裏，將還襲楷，覘知有備，乃止。
八月，甲子，皇後獨孤氏崩。太子對上及宮人哀慟絕氣，若不勝喪者；其處私室，飲食言笑如平常。又，每朝令進二溢米，而私令外取肥肉脯鮓，置竹筩中，以蠟閉口，衣襆裹而納之。
著作郎王劭上言：“佛說："人應生天上及生無量壽國之時，天佛放大光明，以香花妓樂來迎。"伏惟大行皇後福善禎符，備諸秘記，皆雲是妙善菩薩。臣謹按八月二十二日，仁壽宮內再雨金銀花；二十三日，大寶殿後夜有神光；二十四日卯時，永安宮北有自然種種音樂，震滿虛空；至夜五更，奄然如寐，遂卽升遐，與經文所說，事皆符驗。”上覽之悲喜。
九月，丙戌，上至自仁壽宮。
冬，十月，癸醜，以工部尚書楊達為納言。達，雄之弟也。
閏月，甲申，詔楊素、蘇威與吏部尚書牛弘等修定五禮。
上令上儀同三司蕭吉為皇後擇葬地，得吉處，雲：“卜年二千，卜世二百。”上曰：“吉凶由人，不在於地。高緯葬父，豈不卜乎！俄而國亡。正如我家墓田，若雲不吉，朕不當為天子；若雲不凶，我弟不當戰沒。”然竟從吉言。吉退，告族人蕭平仲曰：“皇太子遣宇文左率深謝餘雲："公前稱我當為太子，竟有其驗，終不忘也。今卜山陵，務令我早立。我立之後，當以富貴相報。"吾語之曰："後四載，太子禦天下。"若太子得政，隋其亡乎！吾前紿雲"卜年二千"者，三十字也；"卜世二百"者，取世二傳也。汝其識之！”
壬寅，葬文獻皇後於太陵。詔以“楊素經營葬事，勤求吉地，論素此心，事極誠孝，豈與夫平戎定寇比其功業！可別封一子義康公，邑萬戶。”並賜田三十頃，絹萬段，米萬石，金珠綾錦稱是。
蜀王秀至長安，上見之，不與語；明日，使使切讓之。秀謝罪，太子諸王流涕庭謝。上曰：“頃者秦王糜費財物，我以父道訓之。今秀蠹害生民，當以君道繩之。”於是付執法者。開府儀同三司慶整諫曰：“庶人勇旣廢，秦王已薨，陛下見子無多，何至如是！蜀王性甚耿介，今被重責，恐不自全。”上大怒，欲斷其舌，因謂羣臣曰：“當斬秀於市以謝百姓。”乃令楊素等推治之。
太子陰作偶人，縛手釘心，枷鎖杻械，書上及漢王姓名，仍雲“請西嶽慈父聖母收楊堅、楊諒神魂，如此形狀，勿令散蕩。”密埋之華山下，楊素發之；又雲秀妄述圖讖，稱京師妖異，造蜀地征祥；並作檄文，雲“指期問罪”，置秀集中，俱以聞奏。上曰：“天下寧有是邪！”十二月，癸巳，廢秀為庶人，幽之內侍省，不聽與妻子相見，唯獠婢二人驅使，連坐者百餘人。秀上表摧謝曰：“伏願慈恩，賜垂矜湣，殘息未盡之間，希與瓜子相見；請賜一穴，令骸骨有所。”瓜子，其愛子也。上因下詔數其十罪，且曰：“我今不知楊堅、楊諒是汝何親？”後乃聽與其子同處。
帝晚年深信佛道鬼神，辛巳，始詔“有盜毀佛及天尊、嶽、鎮、海、瀆神像者，以不道論；沙門毀佛像，道士毀天尊像者，以惡逆論。”
是歲，征同州刺史蔡王智積入朝。智積，帝之弟子也。性修謹，門無私謁，自奉簡素，帝甚憐之。智積有五男，止敎讀論語，不令交通賓客。或問其故，智積曰：“卿非知我者！”其意蓋恐諸子有才能以致禍也。
齊州行參軍章武王伽送流囚李參等七十餘人詣京師，行至滎陽，哀其辛苦，悉呼謂曰：“卿輩自犯國刑，身嬰縲絏，固其職也；重勞援卒，豈不愧心哉！”參等辭謝。伽乃悉脫其枷鎖，停援卒，與約曰：“某日當至京師，如致前卻，吾當為汝受死。”遂舍之而去。流人感悅，如期而至，一無離叛。上聞而驚異，召見與語，稱善久之。於是悉召流人，令攜負妻子俱入，賜宴於殿庭而赦之。因下詔曰：“凡在有生，含靈稟性，鹹知善惡，並識是非。若臨以至誠，明加勸導，則俗必從化，人皆遷善。往以海內亂離，德敎廢絕，吏無慈愛之心，民懷奸詐之意。朕思遵聖法，以德化民，而伽深識朕意，誠心倡導，參等感悟，自赴憲司：明是率土之人，非為難敎。若使官盡王伽之儔，民皆李參之輩，刑厝不用，其何遠哉！”乃擢伽為雍令。
太史令袁充表稱：“隋興已後，晝日漸長，開皇元年，冬至之景長一丈二尺七寸二分；自爾漸短，至十七年，短於舊三寸七分。日去極近則景短而日長，去極遠則景長而日短；行內道則去極近，行外道則去極遠。謹按元命包曰："日月出內道，璿璣得其常。"京房別對曰："太平，日行上道；升平，行次道；霸代，行下道。"伏惟大隋啟運，上感幹元，景短日長，振古希有。”上臨朝，謂百官曰：“景長之慶，天之佑也。今太子新立，當須改元，宜取日長之意以為年號。”是後百工作役，並加程課，以日長故也。丁匠苦之。
文帝仁壽元年（辛酉，公元六〇一年）
春，正月，乙酉朔，赦天下，改元。
以尚書右仆射楊素為左仆射，納言蘇威為右仆射。
丁酉，徙河南王昭為晉王。
突厥步迦可汗犯塞，敗代州總管韓弘於恒安。
以晉王昭為內史令。
二月，乙卯朔，日有食之。
夏，五月，己醜，突厥男女九萬口來降。
六月，乙卯，遣十六使巡省風俗。
乙醜，詔以天下學校生徒多而不精，唯簡留國子學生七十人，太學、四門及州縣學並廢。殿內將軍河間劉炫上表切諫，不聽。秋，七月，改國子學為太學。
初，帝受周禪，恐民心未服，故多稱符瑞以耀之，其偽造而獻者，不可勝計。冬，十一月，己醜，有事於南郊，如封禪禮，版文備述前後符瑞以報謝雲。
山獠作亂，以衛尉少卿洛陽衛文升為資州刺史鎮撫之。文升名玄，以字行。初到官，獠方攻大牢鎮，文升單騎造其營，謂曰：“我是刺史，銜天子詔，贍養汝等，勿驚懼也！”羣獠莫敢動。於是說以利害，渠帥感悅，解兵而去，前後歸附者十餘萬口。帝大悅，賜縑二千匹。壬辰，以文升為遂州總管。
潮、成等五州獠反，高州酋長馮盎馳詣京師，請討之。帝敕楊素與盎論賊形勢，素歎曰：“不意蠻夷中有如是人！”卽遣盎發江、嶺兵擊之。事平，除盎漢陽太守。
詔以楊素為雲州道行軍元帥，長孫晟為受降使者，挾啟民可汗北擊步迦。
文帝仁壽二年（壬戌，公元六〇二年）
春，三月，己亥，上幸仁壽宮。
突厥思力俟斤等南渡河，掠啟民男女六千口、雜畜二十餘萬而去。楊素帥諸軍追擊，轉戰六十餘裏，大破之，突厥北走。素複進追，夜，及之，恐其越逸，令其騎稍後，親引兩騎並降突厥二人與虜並行，虜不之覺；候其頓舍未定，趣後騎掩擊，大破之，悉得人畜以歸啟民。自是突厥遠遁，磧南無複寇抄。素以功進子玄感柱國，賜玄縱爵淮南公。
兵部尚書柳述，慶之孫也，尚蘭陵公主，怙寵使氣，自楊素之屬皆下之。帝問符璽直長萬年韋雲起：“外間有不便事，可言之。”述時侍側，雲起奏曰：“柳述驕豪，未嚐經事，兵機要重，非其所堪，徒以主壻，遂居要職。臣恐物議以陛下為"官不擇賢，專私所愛"，斯亦不便之大者。”帝甚然其言，顧謂述曰：“雲起之言，汝藥石也，可師友之。”秋，七月，丙戌，詔內外官各舉所知。柳述舉雲起，除通事舍人。
益州總管蜀王秀，容貌瓌偉，有膽氣，好武藝。帝每謂獨孤後曰：“秀必以惡終，我在當無慮，至兄弟，必反矣。”大將軍劉噲之討西爨也，帝令上開府儀同三司楊武通將兵繼進。秀以嬖人萬智光為武通行軍司馬。帝以秀任非其人，譴責之，因謂羣臣曰：“壞我法者，子孫也。譬如猛虎，物不能害，反為毛間蟲所損食耳。”遂分秀所統。
自長史元岩卒後，秀漸奢僭，造渾天儀，多捕山獠充宦者，車馬被服，擬於乘輿。
及太子勇以讒廢，晉王廣為太子，秀意甚不平。太子恐秀終為後患，陰令楊素求其罪而譖之。上遂征秀，秀猶豫，欲謝病不行。總管司馬源師諫，秀作色曰：“此自我家事，何預卿也！”師垂涕對曰：“師忝參府幕，敢不盡忠！聖上有敕追王，以淹時月，今乃遷延未去。百姓不識王心，儻生異議，內外疑駭，發雷霆之詔，降一介之使，王何以自明？願王熟計之！”朝廷恐秀生變，戊子，以原州總管獨孤楷為益州總管，馳傳代之。楷至，秀猶未肯行；楷諷諭久之，乃就路。楷察秀有悔色，因勒兵為備；秀行四十餘裏，將還襲楷，覘知有備，乃止。
八月，甲子，皇後獨孤氏崩。太子對上及宮人哀慟絕氣，若不勝喪者；其處私室，飲食言笑如平常。又，每朝令進二溢米，而私令外取肥肉脯鮓，置竹筩中，以蠟閉口，衣襆裹而納之。
著作郎王劭上言：“佛說："人應生天上及生無量壽國之時，天佛放大光明，以香花妓樂來迎。"伏惟大行皇後福善禎符，備諸秘記，皆雲是妙善菩薩。臣謹按八月二十二日，仁壽宮內再雨金銀花；二十三日，大寶殿後夜有神光；二十四日卯時，永安宮北有自然種種音樂，震滿虛空；至夜五更，奄然如寐，遂卽升遐，與經文所說，事皆符驗。”上覽之悲喜。
九月，丙戌，上至自仁壽宮。
冬，十月，癸醜，以工部尚書楊達為納言。達，雄之弟也。
閏月，甲申，詔楊素、蘇威與吏部尚書牛弘等修定五禮。
上令上儀同三司蕭吉為皇後擇葬地，得吉處，雲：“卜年二千，卜世二百。”上曰：“吉凶由人，不在於地。高緯葬父，豈不卜乎！俄而國亡。正如我家墓田，若雲不吉，朕不當為天子；若雲不凶，我弟不當戰沒。”然竟從吉言。吉退，告族人蕭平仲曰：“皇太子遣宇文左率深謝餘雲："公前稱我當為太子，竟有其驗，終不忘也。今卜山陵，務令我早立。我立之後，當以富貴相報。"吾語之曰："後四載，太子禦天下。"若太子得政，隋其亡乎！吾前紿雲"卜年二千"者，三十字也；"卜世二百"者，取世二傳也。汝其識之！”
壬寅，葬文獻皇後於太陵。詔以“楊素經營葬事，勤求吉地，論素此心，事極誠孝，豈與夫平戎定寇比其功業！可別封一子義康公，邑萬戶。”並賜田三十頃，絹萬段，米萬石，金珠綾錦稱是。
蜀王秀至長安，上見之，不與語；明日，使使切讓之。秀謝罪，太子諸王流涕庭謝。上曰：“頃者秦王糜費財物，我以父道訓之。今秀蠹害生民，當以君道繩之。”於是付執法者。開府儀同三司慶整諫曰：“庶人勇旣廢，秦王已薨，陛下見子無多，何至如是！蜀王性甚耿介，今被重責，恐不自全。”上大怒，欲斷其舌，因謂羣臣曰：“當斬秀於市以謝百姓。”乃令楊素等推治之。
太子陰作偶人，縛手釘心，枷鎖杻械，書上及漢王姓名，仍雲“請西嶽慈父聖母收楊堅、楊諒神魂，如此形狀，勿令散蕩。”密埋之華山下，楊素發之；又雲秀妄述圖讖，稱京師妖異，造蜀地征祥；並作檄文，雲“指期問罪”，置秀集中，俱以聞奏。上曰：“天下寧有是邪！”十二月，癸巳，廢秀為庶人，幽之內侍省，不聽與妻子相見，唯獠婢二人驅使，連坐者百餘人。秀上表摧謝曰：“伏願慈恩，賜垂矜湣，殘息未盡之間，希與瓜子相見；請賜一穴，令骸骨有所。”瓜子，其愛子也。上因下詔數其十罪，且曰：“我今不知楊堅、楊諒是汝何親？”後乃聽與其子同處。