帝因使援將突騎五千，往來遊說囂將高峻、任禹之屬，下及羌豪，為陳禍福，以離囂支黨。援又為書與囂將楊廣，使曉勸於囂曰：“援竊見四海已定，兆民同情，而季孟閉拒背畔，為天下表的，常懼海內切齒，思相屠裂，故遺書戀戀，以致惻隱之計。乃聞季孟歸罪於援，而納王遊翁諂邪之說，因自謂函穀以西，舉足可定。以今而觀，竟何如邪！
援間至河內，過存伯春，見其奴吉從西方還，說伯春小弟仲舒望見吉，欲問伯春無他否，竟不能言，曉夕號泣。又說其家悲愁之狀，不可言也。夫怨讎可刺不可毀，援聞之，不自知泣下也。援素知季孟孝愛，曾、閔不過。夫孝於其親，豈不慈於其子！可有子抱三木而跳梁妄作，自同分羹之事乎！
季孟平生自言所以擁兵眾者，欲以保全父母之國而完墳墓也，又言苟厚士大夫而已；而今所欲全者將破亡之，所欲完者將傷毀之，所欲厚者將反薄之。季孟嚐折愧子陽而不受其爵，今更共陸陸往附之，將難為顏乎！若複責以重質，當安從得子主給是哉！往時子陽獨欲以王相待而春卿拒之，今者歸老，更欲低頭與小兒曹共槽櫪而食，並肩側身於怨家之朝乎！
今國家待春卿意深，宜使牛孺卿與諸耆老大人共說季孟，若計劃不從，真可引領去矣。前披輿地圖，見天下郡國百有六所，柰何欲以區區二邦以當諸夏百有四乎！春卿事季孟，外有君臣之義，內有朋友之道。言君臣邪，固當諫爭；語朋友邪，應有切磋。豈有知其無成，而但萎腇咋舌，義手從族乎！及今成計，殊尚善也，過是，欲少味矣！且來君叔天下信士，朝廷重之，其意依依，常獨為西州言。援商朝廷，尤欲立信於此，必不負約。援不得久留，願急賜報。”廣竟不答。
諸將每有疑議，更請呼援，鹹敬重焉。
隗囂上疏謝曰：“吏民聞大兵卒至，驚恐自救，臣囂不能禁止。兵有大利，不敢廢臣子之節，親自追還。昔虞舜事父，大杖則走，小杖則受。臣雖不敏，敢忘斯義！今臣之事，在於本朝，賜死則死，加刑則刑；如更得洗心，死骨不朽。”有司以囂言慢，請誅其子；帝不忍，複使來歙至汧，賜囂書曰：“昔柴將軍雲："陛下寬仁，諸侯雖有亡叛而後歸，輒複位號，不誅也。"今若束手，複遣恂弟歸闕庭者，則爵祿獲全，有浩大之福矣！吾年垂四十，在兵中十歲，厭浮語虛辭。卽不欲，勿報。”囂知帝審其詐，遂遣使稱臣於公孫述。
匈奴與盧芳為寇不息，帝令歸德侯颯使匈奴以修舊好。單於驕倨，雖遣使報命，而寇暴如故。
光武帝建武七年（辛卯、三一年）
春，三月，罷郡國輕車、騎士、材官，令還複民伍。
公孫述立隗囂為朔寧王，遣兵往來，為之援勢。
癸亥晦，日有食之。詔百僚各上封事，其上書者不得言聖。太中大夫鄭興上疏曰：“夫國無善政，則謫見日月；要在因人之心，擇人處位。今公卿大夫多舉漁陽太守郭伋可大司空者，而不以時定；道路流言，鹹曰"朝廷欲用功臣"，功臣用則人位謬矣。願陛下屈己從眾，以濟羣臣讓善之功。頃年日食多在晦，先時而合，皆月行疾也。日君象而月臣象；君亢急而臣下促迫，故月行疾。今陛下高明而羣臣惶促，宜留思柔克之政，垂意洪範之法。”帝躬勤政事，頗傷嚴急，故興奏及之。
夏，四月，壬午，大赦。
五月，戊戌，以前將軍李通為大司空。
大司農江馮上言：“宜令司隸校尉督察三公。”司空掾陳元上疏曰：“臣聞師臣者帝，賓臣者霸。故武王以太公為師，齊桓以夷吾為仲父，近則高帝優相國之禮，太宗假宰輔之權。及亡新王莽，遭漢中衰，專操國柄以偷天下，況己自喻，不信羣臣，奪公輔之任，損宰相之威，以刺舉為明，激訐為直，至乃陪仆告其君長，子弟變其父兄，罔密法峻，大臣無所措手足；然不能禁董忠之謀，身為世戮。方今四方尚擾，天下未一，百姓觀聽，鹹張耳目。陛下宜修文、武之聖典，襲祖宗之遺德，勞心下士，屈節待賢，誠不宜使有司察公輔之名。”帝從之。
酒泉太守竺曾以弟報怨殺人，自免去郡；竇融承製拜曾武鋒將軍，更以辛肜為酒泉太守。
秋，隗囂將步騎三萬侵安定，至陰盤，馮異率諸將拒之；囂又令別將下隴攻祭遵於汧：並無利而還。
帝將自征隗囂，先戒竇融師期，會遇雨，道斷，且囂兵已退，乃止。
帝令來歙以書招王遵，遵來降，拜太中大夫，封向義侯。
冬，盧芳以事誅其五原太守李興兄弟；其朔方太守田颯、雲中太守喬扈各舉郡降，帝令領職如故。
帝好圖讖，與鄭興議郊祀事，曰：“吾欲以讖斷之，何如？”對曰：“臣不為讖！”帝怒曰：“卿不為讖，非之邪？”興惶恐曰：“臣於書有所未學，而無所非也。”帝意乃解。
南陽太守杜詩政治清平，興利除害，百姓便之。又修治陂池，廣拓土田，郡內比室殷足，時人方於召信臣。南陽為之語曰：“前有召父，後有杜母。”
光武帝建武八年（壬辰、三二年）
春，來歙將二千餘人伐山開道，從番須、回中徑襲略陽，斬隗囂守將金梁。囂大驚曰：“何其神也！”帝聞得略陽，甚喜，曰：“略陽，囂所依阻，心腹已壞，則製其支體易矣！”
吳漢等諸將聞歙據略陽，爭馳赴之。上以為囂失所恃，亡其要城，勢必悉以精銳來攻；曠日久圍而城不拔，士卒頓敝，乃可乘危而進。皆追漢等還。隗囂果使王元拒隴坻，行巡守番須口，王孟塞雞頭道，牛邯軍瓦亭。囂自悉其大眾數萬人圍略陽，公孫述遣將李育、田弇助之，斬山築堤，激水灌城。來歙與將士固死堅守，矢盡，發屋斷木以為兵。囂盡銳攻之，累月不能下。
夏，閏四月，帝自將征隗囂，光祿勳汝南郭憲諫曰：“東方初定，車駕未可遠征。”乃當車拔佩刀以斷車靷。帝不從，西至漆。諸將多以王師之重，不宜遠入險阻，計冘豫未決；帝召馬援問之。援因說隗囂將帥有土崩之勢，兵進有必破之狀；又於帝前聚米為山穀，指畫形勢，開示眾軍所從道徑，往來分析，昭然可曉。帝曰：“虜在吾目中矣！”明旦，遂進軍，至高平第一。
竇融率五郡太守及羌虜小月氏等步騎數萬，輜重五千餘兩，與大軍會。是時軍旅草創，諸將朝會禮容多不肅，融先遣從事問會見儀適。帝聞而善之，以宣告百僚，乃置酒高會，待融等以殊禮。
遂共進軍，數道上隴。使王遵以書招牛邯，下之，拜邯太中大夫。於是囂大將十三人、屬縣十六、眾十餘萬皆降。囂將妻子奔西城，從楊廣，而田弇、李育保上邽。略陽圍解。帝勞賜來歙，班坐絕席，在諸將之右，賜歙妻縑千匹。
進幸上邽，詔告隗囂曰：“若束手自詣，父子相見，保無他也。若遂欲為黥布者，亦自任也。”囂終不降，於是誅其子恂。使吳漢、岑彭圍西城，耿弇、蓋延圍上邽。
以四縣封竇融為安豐侯，弟友為顯親侯，及五郡太守皆封列侯，遣西還所鎮。融以久專方麵，懼不自安，數上書求代；詔報曰：“吾與將軍如左右手耳，數執謙退，何不曉人意！勉循士民，無擅離部曲！”
潁川盜賊羣起，寇沒屬縣，河東守兵亦叛，京師騷動。帝聞之曰：“吾悔不用郭子橫之言。”秋，八月，帝自上邽晨夜東馳，賜岑彭等書曰：“兩城若下，便可將兵南擊蜀虜。人苦不知足，旣平隴，複望蜀。每一發兵，頭須為白！”
九月，乙卯，車駕還宮。帝謂執金吾寇恂曰：“潁川迫近京師，當以時定。惟念獨卿能平之耳，從九卿複出以憂國可也！”對曰：“潁川聞陛下有事隴、蜀，故狂狡乘間相詿誤耳。如聞乘輿南向，賊必惶怖歸死，臣願執銳前驅。”帝從之。庚申，車駕南征，潁川盜賊悉降。寇恂竟不拜郡，百姓遮道曰：“願從陛下複借寇君一年。”乃留恂長社，鎮撫吏民，受納餘降。
東郡、濟陰盜賊亦起，帝遣李通、王常擊之。以東光侯耿純嚐為東郡太守，威信著於衛地，遣使拜太中大夫，使與大兵會東郡。東郡聞純入界，盜賊九千餘人皆詣純降，大兵不戰而還；璽書複以純為東郡太守。戊寅，車駕還自潁川。
安丘侯張步將妻子逃奔臨淮，與弟弘、藍欲招其故眾，乘船入海；琅邪太守陳俊追討，斬之。
冬，十月，丙午，上行幸懷；十一月，乙醜，還雒陽。
援間至河內，過存伯春，見其奴吉從西方還，說伯春小弟仲舒望見吉，欲問伯春無他否，竟不能言，曉夕號泣。又說其家悲愁之狀，不可言也。夫怨讎可刺不可毀，援聞之，不自知泣下也。援素知季孟孝愛，曾、閔不過。夫孝於其親，豈不慈於其子！可有子抱三木而跳梁妄作，自同分羹之事乎！
季孟平生自言所以擁兵眾者，欲以保全父母之國而完墳墓也，又言苟厚士大夫而已；而今所欲全者將破亡之，所欲完者將傷毀之，所欲厚者將反薄之。季孟嚐折愧子陽而不受其爵，今更共陸陸往附之，將難為顏乎！若複責以重質，當安從得子主給是哉！往時子陽獨欲以王相待而春卿拒之，今者歸老，更欲低頭與小兒曹共槽櫪而食，並肩側身於怨家之朝乎！
今國家待春卿意深，宜使牛孺卿與諸耆老大人共說季孟，若計劃不從，真可引領去矣。前披輿地圖，見天下郡國百有六所，柰何欲以區區二邦以當諸夏百有四乎！春卿事季孟，外有君臣之義，內有朋友之道。言君臣邪，固當諫爭；語朋友邪，應有切磋。豈有知其無成，而但萎腇咋舌，義手從族乎！及今成計，殊尚善也，過是，欲少味矣！且來君叔天下信士，朝廷重之，其意依依，常獨為西州言。援商朝廷，尤欲立信於此，必不負約。援不得久留，願急賜報。”廣竟不答。
諸將每有疑議，更請呼援，鹹敬重焉。
隗囂上疏謝曰：“吏民聞大兵卒至，驚恐自救，臣囂不能禁止。兵有大利，不敢廢臣子之節，親自追還。昔虞舜事父，大杖則走，小杖則受。臣雖不敏，敢忘斯義！今臣之事，在於本朝，賜死則死，加刑則刑；如更得洗心，死骨不朽。”有司以囂言慢，請誅其子；帝不忍，複使來歙至汧，賜囂書曰：“昔柴將軍雲："陛下寬仁，諸侯雖有亡叛而後歸，輒複位號，不誅也。"今若束手，複遣恂弟歸闕庭者，則爵祿獲全，有浩大之福矣！吾年垂四十，在兵中十歲，厭浮語虛辭。卽不欲，勿報。”囂知帝審其詐，遂遣使稱臣於公孫述。
匈奴與盧芳為寇不息，帝令歸德侯颯使匈奴以修舊好。單於驕倨，雖遣使報命，而寇暴如故。
光武帝建武七年（辛卯、三一年）
春，三月，罷郡國輕車、騎士、材官，令還複民伍。
公孫述立隗囂為朔寧王，遣兵往來，為之援勢。
癸亥晦，日有食之。詔百僚各上封事，其上書者不得言聖。太中大夫鄭興上疏曰：“夫國無善政，則謫見日月；要在因人之心，擇人處位。今公卿大夫多舉漁陽太守郭伋可大司空者，而不以時定；道路流言，鹹曰"朝廷欲用功臣"，功臣用則人位謬矣。願陛下屈己從眾，以濟羣臣讓善之功。頃年日食多在晦，先時而合，皆月行疾也。日君象而月臣象；君亢急而臣下促迫，故月行疾。今陛下高明而羣臣惶促，宜留思柔克之政，垂意洪範之法。”帝躬勤政事，頗傷嚴急，故興奏及之。
夏，四月，壬午，大赦。
五月，戊戌，以前將軍李通為大司空。
大司農江馮上言：“宜令司隸校尉督察三公。”司空掾陳元上疏曰：“臣聞師臣者帝，賓臣者霸。故武王以太公為師，齊桓以夷吾為仲父，近則高帝優相國之禮，太宗假宰輔之權。及亡新王莽，遭漢中衰，專操國柄以偷天下，況己自喻，不信羣臣，奪公輔之任，損宰相之威，以刺舉為明，激訐為直，至乃陪仆告其君長，子弟變其父兄，罔密法峻，大臣無所措手足；然不能禁董忠之謀，身為世戮。方今四方尚擾，天下未一，百姓觀聽，鹹張耳目。陛下宜修文、武之聖典，襲祖宗之遺德，勞心下士，屈節待賢，誠不宜使有司察公輔之名。”帝從之。
酒泉太守竺曾以弟報怨殺人，自免去郡；竇融承製拜曾武鋒將軍，更以辛肜為酒泉太守。
秋，隗囂將步騎三萬侵安定，至陰盤，馮異率諸將拒之；囂又令別將下隴攻祭遵於汧：並無利而還。
帝將自征隗囂，先戒竇融師期，會遇雨，道斷，且囂兵已退，乃止。
帝令來歙以書招王遵，遵來降，拜太中大夫，封向義侯。
冬，盧芳以事誅其五原太守李興兄弟；其朔方太守田颯、雲中太守喬扈各舉郡降，帝令領職如故。
帝好圖讖，與鄭興議郊祀事，曰：“吾欲以讖斷之，何如？”對曰：“臣不為讖！”帝怒曰：“卿不為讖，非之邪？”興惶恐曰：“臣於書有所未學，而無所非也。”帝意乃解。
南陽太守杜詩政治清平，興利除害，百姓便之。又修治陂池，廣拓土田，郡內比室殷足，時人方於召信臣。南陽為之語曰：“前有召父，後有杜母。”
光武帝建武八年（壬辰、三二年）
春，來歙將二千餘人伐山開道，從番須、回中徑襲略陽，斬隗囂守將金梁。囂大驚曰：“何其神也！”帝聞得略陽，甚喜，曰：“略陽，囂所依阻，心腹已壞，則製其支體易矣！”
吳漢等諸將聞歙據略陽，爭馳赴之。上以為囂失所恃，亡其要城，勢必悉以精銳來攻；曠日久圍而城不拔，士卒頓敝，乃可乘危而進。皆追漢等還。隗囂果使王元拒隴坻，行巡守番須口，王孟塞雞頭道，牛邯軍瓦亭。囂自悉其大眾數萬人圍略陽，公孫述遣將李育、田弇助之，斬山築堤，激水灌城。來歙與將士固死堅守，矢盡，發屋斷木以為兵。囂盡銳攻之，累月不能下。
夏，閏四月，帝自將征隗囂，光祿勳汝南郭憲諫曰：“東方初定，車駕未可遠征。”乃當車拔佩刀以斷車靷。帝不從，西至漆。諸將多以王師之重，不宜遠入險阻，計冘豫未決；帝召馬援問之。援因說隗囂將帥有土崩之勢，兵進有必破之狀；又於帝前聚米為山穀，指畫形勢，開示眾軍所從道徑，往來分析，昭然可曉。帝曰：“虜在吾目中矣！”明旦，遂進軍，至高平第一。
竇融率五郡太守及羌虜小月氏等步騎數萬，輜重五千餘兩，與大軍會。是時軍旅草創，諸將朝會禮容多不肅，融先遣從事問會見儀適。帝聞而善之，以宣告百僚，乃置酒高會，待融等以殊禮。
遂共進軍，數道上隴。使王遵以書招牛邯，下之，拜邯太中大夫。於是囂大將十三人、屬縣十六、眾十餘萬皆降。囂將妻子奔西城，從楊廣，而田弇、李育保上邽。略陽圍解。帝勞賜來歙，班坐絕席，在諸將之右，賜歙妻縑千匹。
進幸上邽，詔告隗囂曰：“若束手自詣，父子相見，保無他也。若遂欲為黥布者，亦自任也。”囂終不降，於是誅其子恂。使吳漢、岑彭圍西城，耿弇、蓋延圍上邽。
以四縣封竇融為安豐侯，弟友為顯親侯，及五郡太守皆封列侯，遣西還所鎮。融以久專方麵，懼不自安，數上書求代；詔報曰：“吾與將軍如左右手耳，數執謙退，何不曉人意！勉循士民，無擅離部曲！”
潁川盜賊羣起，寇沒屬縣，河東守兵亦叛，京師騷動。帝聞之曰：“吾悔不用郭子橫之言。”秋，八月，帝自上邽晨夜東馳，賜岑彭等書曰：“兩城若下，便可將兵南擊蜀虜。人苦不知足，旣平隴，複望蜀。每一發兵，頭須為白！”
九月，乙卯，車駕還宮。帝謂執金吾寇恂曰：“潁川迫近京師，當以時定。惟念獨卿能平之耳，從九卿複出以憂國可也！”對曰：“潁川聞陛下有事隴、蜀，故狂狡乘間相詿誤耳。如聞乘輿南向，賊必惶怖歸死，臣願執銳前驅。”帝從之。庚申，車駕南征，潁川盜賊悉降。寇恂竟不拜郡，百姓遮道曰：“願從陛下複借寇君一年。”乃留恂長社，鎮撫吏民，受納餘降。
東郡、濟陰盜賊亦起，帝遣李通、王常擊之。以東光侯耿純嚐為東郡太守，威信著於衛地，遣使拜太中大夫，使與大兵會東郡。東郡聞純入界，盜賊九千餘人皆詣純降，大兵不戰而還；璽書複以純為東郡太守。戊寅，車駕還自潁川。
安丘侯張步將妻子逃奔臨淮，與弟弘、藍欲招其故眾，乘船入海；琅邪太守陳俊追討，斬之。
冬，十月，丙午，上行幸懷；十一月，乙醜，還雒陽。